More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2944 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2944  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 172 aa  347  4e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.281269  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  67.19 
 
 		 286 aa  75.5  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  64.18 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 		 973 aa  73.6  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  55.7 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  58.23 
 
 		 900 aa  72.8  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2086  hypothetical protein  58.33 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3786  pentapeptide repeat-containing protein  59.72 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5479  hypothetical protein  60.94 
 
 		 279 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0226407  decreased coverage  0.00750026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3735  pentapeptide repeat-containing protein  59.72 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0192  pentapeptide repeat-containing protein  64.41 
 
 		 181 aa  72  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.493873  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  42.15 
 
 		 266 aa  71.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  52 
 
 		 340 aa  70.9  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0864  heat shock protein DnaJ-like  60.76 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  61.19 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  52.33 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  55.71 
 
 		 745 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  66.15 
 
 		 1033 aa  69.7  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  56.58 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  52.05 
 
 		 336 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  53.09 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  52.05 
 
 		 336 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  55.41 
 
 		 567 aa  68.6  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0205  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  53.25 
 
 		 537 aa  68.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.47043 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4759  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  59.49 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  50.7 
 
 		 234 aa  67.8  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  59.09 
 
 		 234 aa  67.4  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  49.41 
 
 		 245 aa  67.8  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  59.09 
 
 		 234 aa  67.4  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0523  pentapeptide repeat protein  48 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.567805  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  58.21 
 
 		 320 aa  67.4  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  52.24 
 
 		 267 aa  67.4  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  59.7 
 
 		 179 aa  67.4  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  54.67 
 
 		 182 aa  67.4  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  64.18 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  48.84 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  60.81 
 
 		 143 aa  67  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  47.19 
 
 		 489 aa  67  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  55.22 
 
 		 517 aa  67.4  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1375  pentapeptide repeat protein  31.9 
 
 		 514 aa  66.6  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  59.42 
 
 		 521 aa  66.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  61.9 
 
 		 438 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  59.42 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  55.41 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  50 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  55.84 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4620  pentapeptide repeat protein  64.52 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  49.33 
 
 		 381 aa  65.5  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  52.17 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5950  pentapeptide repeat protein  45.56 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  57.5 
 
 		 343 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  57.5 
 
 		 343 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  48.72 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  53.75 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0686  pentapeptide repeat-containing protein  57.14 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0322373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2772  pentapeptide repeat-containing protein  52.44 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  54.17 
 
 		 268 aa  65.1  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  57.14 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  51.47 
 
 		 491 aa  65.5  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4249  pentapeptide repeat-containing protein  49.43 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5548  pentapeptide repeat protein  48.78 
 
 		 276 aa  64.7  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262169  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  61.43 
 
 		 389 aa  64.7  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  55 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  48.24 
 
 		 493 aa  64.7  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  48.81 
 
 		 294 aa  64.7  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  60.32 
 
 		 260 aa  64.7  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  42.53 
 
 		 497 aa  64.3  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  58.21 
 
 		 292 aa  64.3  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 		 576 aa  64.3  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  57.35 
 
 		 273 aa  64.3  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  38.46 
 
 		 291 aa  64.3  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  46.43 
 
 		 363 aa  64.3  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 		 250 aa  63.9  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  52.56 
 
 		 903 aa  64.3  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  61.29 
 
 		 386 aa  63.9  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  61.54 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0691  hypothetical protein  50.59 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  46.91 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  51.76 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0258  hypothetical protein  57.81 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3522  pentapeptide repeat-containing protein  58.57 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.894088  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  50 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  50 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2987  pentapeptide repeat protein  55.07 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  48.28 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2972  pentapeptide repeat protein  51.43 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3313  hypothetical protein  63.93 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  57.38 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1060  pentapeptide repeat-containing protein  44.71 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0113174  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  50.67 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  52.05 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4837  pentapeptide repeat-containing protein  54.05 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000291889  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  58.21 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  39.62 
 
 		 824 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  52.17 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  51.25 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  57.38 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  45.26 
 
 		 710 aa  63.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  51.9 
 
 		 446 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  62.9 
 
 		 872 aa  62.4  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>