More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5548 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5548  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 276 aa  548  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262169  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5479  hypothetical protein  61.69 
 
 		 279 aa  304  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0226407  decreased coverage  0.00750026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2406  pentapeptide repeat-containing protein  58.56 
 
 		 288 aa  269  4e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2300  pentapeptide repeat-containing protein  56.18 
 
 		 345 aa  267  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000752712  normal  0.0184634 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1850  pentapeptide repeats domain protein  49.25 
 
 		 273 aa  262  3e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3159  pentapeptide repeat-containing oxetanocin A resistance protein  48.13 
 
 		 273 aa  259  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3394  pentapeptide repeats domain protein  48.13 
 
 		 273 aa  259  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3099  pentapeptide repeat-containing protein  47.99 
 
 		 284 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.240608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3175  pentapeptide repeat-containing protein  48.13 
 
 		 273 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3425  pentapeptide repeat-containing protein  48.13 
 
 		 273 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3076  pentapeptide repeat-containing oxetanocin A resistance protein  47.19 
 
 		 273 aa  256  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3406  pentapeptide repeats domain protein  48.11 
 
 		 273 aa  255  5e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3381  pentapeptide repeats domain protein  47.74 
 
 		 273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2555  pentapeptide repeat-containing protein  53.96 
 
 		 290 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000219025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4130  pentapeptide repeat-containing protein  51.89 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.745162  normal  0.353762 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07960  uncharacterized low-complexity protein  53.38 
 
 		 286 aa  249  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0731853  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28820  uncharacterized low-complexity protein  53.08 
 
 		 298 aa  242  3.9999999999999997e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.190064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5950  pentapeptide repeat protein  51.15 
 
 		 289 aa  233  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3741  pentapeptide repeat protein  49.62 
 
 		 280 aa  223  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0691  hypothetical protein  48.85 
 
 		 264 aa  222  6e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2170  pentapeptide repeat protein  52.1 
 
 		 296 aa  219  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0057  pentapeptide repeat protein  46.47 
 
 		 283 aa  205  7e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4358  pentapeptide repeat-containing protein  46.99 
 
 		 264 aa  189  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205207  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4196  pentapeptide repeat protein  56 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4156  pentapeptide repeat protein  56 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3404  pentapeptide repeat-containing protein  55 
 
 		 60 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638482  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  46.09 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  51.35 
 
 		 497 aa  65.9  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  56.52 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2944  pentapeptide repeat-containing protein  48.78 
 
 		 172 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.281269  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  31.52 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0258  hypothetical protein  60.29 
 
 		 147 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  44.33 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  59.02 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1260  pentapeptide repeat-containing protein  44.04 
 
 		 162 aa  64.3  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  hitchhiker  0.00173599 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  55 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  51.69 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  48 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  58.46 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  59.32 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  58.46 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  45.68 
 
 		 331 aa  62.4  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  62.07 
 
 		 973 aa  62.4  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  53.97 
 
 		 903 aa  62.4  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  43.43 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  50 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  61.67 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3735  pentapeptide repeat-containing protein  63.79 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  48.84 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3786  pentapeptide repeat-containing protein  63.79 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  43.27 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  45.78 
 
 		 168 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  50.65 
 
 		 900 aa  60.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  54.84 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2086  hypothetical protein  60 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1185  hypothetical protein  52.17 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  59.65 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  51.43 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  60 
 
 		 1033 aa  59.3  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  52.11 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  53.62 
 
 		 179 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  54.17 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  40.62 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5019  pentapeptide repeat-containing protein  48.84 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  48.86 
 
 		 184 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  41.84 
 
 		 489 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0386  pentapeptide repeat protein  39.58 
 
 		 509 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  46.25 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  46.25 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2440  pentapeptide repeat protein  32.86 
 
 		 830 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  58.33 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  48.75 
 
 		 1831 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  52.86 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  55.17 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  48.68 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0823  pentapeptide repeat-containing protein  51.61 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000611936  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  51.47 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0415  hypothetical protein  55.88 
 
 		 325 aa  57  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3670  pentapeptide repeat protein  32.86 
 
 		 830 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.414516  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4837  pentapeptide repeat-containing protein  49.21 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000291889  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  49.45 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  56.9 
 
 		 745 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0783  pentapeptide repeat protein  44.21 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  41.38 
 
 		 824 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0810  pentapeptide repeat protein  44.21 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  53.42 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  51.67 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2972  pentapeptide repeat protein  45 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0475  pentapeptide repeat-containing protein  52.56 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.019443 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  44.44 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.67 
 
 		 14916 aa  55.8  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  47.14 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0686  pentapeptide repeat-containing protein  59.57 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0322373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  40.43 
 
 		 312 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0188  pentapeptide repeat-containing protein  46.15 
 
 		 99 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  46.84 
 
 		 381 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  45 
 
 		 206 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>