40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3404 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3404  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
60 aa  124  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638482  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3394  pentapeptide repeats domain protein  93.33 
 
 
273 aa  120  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3175  pentapeptide repeat-containing protein  93.33 
 
 
273 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3381  pentapeptide repeats domain protein  93.33 
 
 
273 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3425  pentapeptide repeat-containing protein  93.33 
 
 
273 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3076  pentapeptide repeat-containing oxetanocin A resistance protein  91.67 
 
 
273 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1850  pentapeptide repeats domain protein  91.67 
 
 
273 aa  118  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3159  pentapeptide repeat-containing oxetanocin A resistance protein  91.67 
 
 
273 aa  118  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3406  pentapeptide repeats domain protein  91.67 
 
 
273 aa  118  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3099  pentapeptide repeat-containing protein  87.93 
 
 
284 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.240608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5479  hypothetical protein  63.79 
 
 
279 aa  81.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0226407  decreased coverage  0.00750026 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07960  uncharacterized low-complexity protein  62.07 
 
 
286 aa  82  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0731853  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5950  pentapeptide repeat protein  65.52 
 
 
289 aa  81.6  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28820  uncharacterized low-complexity protein  62.07 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.190064 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2300  pentapeptide repeat-containing protein  56.9 
 
 
345 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000752712  normal  0.0184634 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3741  pentapeptide repeat protein  56.9 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2555  pentapeptide repeat-containing protein  56.67 
 
 
290 aa  73.9  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000219025 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2170  pentapeptide repeat protein  56.67 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5548  pentapeptide repeat protein  55 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262169  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2406  pentapeptide repeat-containing protein  53.33 
 
 
288 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584287  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4130  pentapeptide repeat-containing protein  48 
 
 
308 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.745162  normal  0.353762 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0691  hypothetical protein  58.18 
 
 
264 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0057  pentapeptide repeat protein  50 
 
 
283 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5019  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 
298 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4358  pentapeptide repeat-containing protein  52.63 
 
 
264 aa  53.9  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205207  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  44.83 
 
 
381 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  41.1 
 
 
411 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  41.67 
 
 
361 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1260  pentapeptide repeat-containing protein  47.17 
 
 
162 aa  48.9  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  hitchhiker  0.00173599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  44.83 
 
 
418 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  44.64 
 
 
416 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1862  hypothetical protein  41.18 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.833098  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6262  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 
408 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104366  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  45.45 
 
 
433 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  40 
 
 
408 aa  44.3  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2559  pentapeptide repeat-containing protein  42.59 
 
 
163 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 
273 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  45.45 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  43.4 
 
 
312 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5902  hypothetical protein  45.1 
 
 
241 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>