More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_07960 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_07960  uncharacterized low-complexity protein  100 
 
 		 286 aa  566  1e-160  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0731853  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5479  hypothetical protein  59.77 
 
 		 279 aa  303  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0226407  decreased coverage  0.00750026 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3381  pentapeptide repeats domain protein  51.88 
 
 		 273 aa  291  8e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3394  pentapeptide repeats domain protein  50.94 
 
 		 273 aa  287  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3175  pentapeptide repeat-containing protein  50.94 
 
 		 273 aa  286  4e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3159  pentapeptide repeat-containing oxetanocin A resistance protein  50.94 
 
 		 273 aa  285  4e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1850  pentapeptide repeats domain protein  51.13 
 
 		 273 aa  286  4e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3425  pentapeptide repeat-containing protein  50.94 
 
 		 273 aa  286  4e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3406  pentapeptide repeats domain protein  51.13 
 
 		 273 aa  285  8e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3099  pentapeptide repeat-containing protein  50.38 
 
 		 284 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.240608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3076  pentapeptide repeat-containing oxetanocin A resistance protein  49.81 
 
 		 273 aa  280  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28820  uncharacterized low-complexity protein  55.96 
 
 		 298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.190064 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2300  pentapeptide repeat-containing protein  57.46 
 
 		 345 aa  269  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000752712  normal  0.0184634 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2406  pentapeptide repeat-containing protein  57.25 
 
 		 288 aa  261  6e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3741  pentapeptide repeat protein  56.39 
 
 		 280 aa  260  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5950  pentapeptide repeat protein  53.05 
 
 		 289 aa  253  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5548  pentapeptide repeat protein  54.07 
 
 		 276 aa  253  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262169  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4130  pentapeptide repeat-containing protein  53.79 
 
 		 308 aa  249  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.745162  normal  0.353762 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0691  hypothetical protein  52.67 
 
 		 264 aa  245  8e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2555  pentapeptide repeat-containing protein  53.05 
 
 		 290 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000219025 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0057  pentapeptide repeat protein  49.25 
 
 		 283 aa  219  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2170  pentapeptide repeat protein  51.41 
 
 		 296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4358  pentapeptide repeat-containing protein  47.92 
 
 		 264 aa  191  9e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205207  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3404  pentapeptide repeat-containing protein  62.07 
 
 		 60 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638482  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  51.81 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5019  pentapeptide repeat-containing protein  47.12 
 
 		 298 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  60.32 
 
 		 903 aa  66.6  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 		 416 aa  65.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  61.67 
 
 		 1033 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  46.67 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  47.62 
 
 		 411 aa  62.4  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  50.62 
 
 		 973 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1260  pentapeptide repeat-containing protein  48.84 
 
 		 162 aa  61.6  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  hitchhiker  0.00173599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  51.16 
 
 		 418 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  41.76 
 
 		 489 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  43.62 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  40.54 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  51.43 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  45.78 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0258  hypothetical protein  58.33 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  39.42 
 
 		 179 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  51.47 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  44.21 
 
 		 213 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  45.63 
 
 		 184 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4156  pentapeptide repeat protein  48.05 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4196  pentapeptide repeat protein  48.05 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1862  hypothetical protein  42.5 
 
 		 103 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.833098  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  40 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  40 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  51.61 
 
 		 168 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  47.83 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  36.7 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  46.34 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2559  pentapeptide repeat-containing protein  43.02 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  57.58 
 
 		 900 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  53.42 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  44 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  43.62 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  41 
 
 		 493 aa  55.8  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  45.98 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  42.57 
 
 		 433 aa  55.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  31.88 
 
 		 446 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  43.42 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  49.21 
 
 		 214 aa  55.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3735  pentapeptide repeat-containing protein  60 
 
 		 206 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  48.86 
 
 		 259 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  41 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0369  pentapeptide repeat-containing protein  33.78 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  44.09 
 
 		 517 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3786  pentapeptide repeat-containing protein  60 
 
 		 206 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  36.61 
 
 		 204 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  55.56 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  50 
 
 		 199 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  38.1 
 
 		 361 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2409  pentapeptide repeat-containing protein  49.12 
 
 		 885 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  39.42 
 
 		 263 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  51.56 
 
 		 199 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  56.92 
 
 		 277 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2772  pentapeptide repeat-containing protein  43.68 
 
 		 129 aa  53.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  57.41 
 
 		 255 aa  53.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0686  pentapeptide repeat-containing protein  48.33 
 
 		 152 aa  53.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0322373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  56.9 
 
 		 447 aa  53.1  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  37.07 
 
 		 312 aa  53.1  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.24 
 
 		 14916 aa  53.1  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3601  pentapeptide repeat protein  38.61 
 
 		 371 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  54.55 
 
 		 521 aa  52.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  49.18 
 
 		 576 aa  52.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  55.36 
 
 		 340 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6262  pentapeptide repeat-containing protein  31.09 
 
 		 408 aa  52.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104366  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  58.62 
 
 		 449 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3670  pentapeptide repeat protein  40.7 
 
 		 830 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.414516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  43.86 
 
 		 381 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  37.25 
 
 		 267 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  38.79 
 
 		 363 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  54.55 
 
 		 299 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  44.32 
 
 		 332 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2086  hypothetical protein  49.35 
 
 		 156 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4134  pentapeptide repeat protein  42.53 
 
 		 137 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.159468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  38.82 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>