More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_28820 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_28820  uncharacterized low-complexity protein  100 
 
 		 298 aa  589  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.190064 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3159  pentapeptide repeat-containing oxetanocin A resistance protein  49.45 
 
 		 273 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3381  pentapeptide repeats domain protein  50.76 
 
 		 273 aa  271  9e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3394  pentapeptide repeats domain protein  49.45 
 
 		 273 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3099  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 		 284 aa  270  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.240608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3175  pentapeptide repeat-containing protein  49.45 
 
 		 273 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3425  pentapeptide repeat-containing protein  49.45 
 
 		 273 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5479  hypothetical protein  53.82 
 
 		 279 aa  269  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0226407  decreased coverage  0.00750026 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1850  pentapeptide repeats domain protein  50.38 
 
 		 273 aa  269  5e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3406  pentapeptide repeats domain protein  49.62 
 
 		 273 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3076  pentapeptide repeat-containing oxetanocin A resistance protein  48.34 
 
 		 273 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07960  uncharacterized low-complexity protein  55.96 
 
 		 286 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0731853  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0691  hypothetical protein  54.55 
 
 		 264 aa  257  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2300  pentapeptide repeat-containing protein  54.48 
 
 		 345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000752712  normal  0.0184634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5950  pentapeptide repeat protein  52.67 
 
 		 289 aa  253  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3741  pentapeptide repeat protein  53.01 
 
 		 280 aa  253  3e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2406  pentapeptide repeat-containing protein  53.53 
 
 		 288 aa  246  4e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2555  pentapeptide repeat-containing protein  51.88 
 
 		 290 aa  245  6.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000219025 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5548  pentapeptide repeat protein  53.08 
 
 		 276 aa  242  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262169  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4130  pentapeptide repeat-containing protein  52.11 
 
 		 308 aa  238  5.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.745162  normal  0.353762 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2170  pentapeptide repeat protein  54.64 
 
 		 296 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0057  pentapeptide repeat protein  46.24 
 
 		 283 aa  215  7e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4358  pentapeptide repeat-containing protein  47.17 
 
 		 264 aa  197  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205207  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3404  pentapeptide repeat-containing protein  62.07 
 
 		 60 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638482  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5019  pentapeptide repeat-containing protein  51.09 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  40.74 
 
 		 447 aa  65.9  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  39.09 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  47.13 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  49.38 
 
 		 900 aa  63.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  49.43 
 
 		 418 aa  62.8  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1260  pentapeptide repeat-containing protein  47.73 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  hitchhiker  0.00173599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  47.12 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 		 973 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  52.78 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2944  pentapeptide repeat-containing protein  55.38 
 
 		 172 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.281269  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  35.45 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  43.93 
 
 		 433 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  58.62 
 
 		 1033 aa  59.3  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  59.32 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  39.56 
 
 		 576 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0188  pentapeptide repeat-containing protein  46.91 
 
 		 99 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  48.24 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  51.43 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  39.29 
 
 		 143 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  52.46 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5902  hypothetical protein  34.85 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6262  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 		 408 aa  57  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104366  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  44.44 
 
 		 903 aa  56.6  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  46.36 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3786  pentapeptide repeat-containing protein  54.17 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  45.45 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3735  pentapeptide repeat-containing protein  54.17 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1862  hypothetical protein  41.24 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.833098  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0997  pentapeptide repeat protein  37.74 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  56.14 
 
 		 336 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  56.14 
 
 		 336 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  37.37 
 
 		 442 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2086  hypothetical protein  43.75 
 
 		 156 aa  55.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2559  pentapeptide repeat-containing protein  35.07 
 
 		 163 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4759  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.82 
 
 		 222 aa  55.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4837  pentapeptide repeat-containing protein  40.23 
 
 		 151 aa  55.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000291889  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  51.61 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  51.61 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0864  heat shock protein DnaJ-like  43.82 
 
 		 217 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  59.32 
 
 		 184 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2272  pentapeptide repeat-containing protein  32.85 
 
 		 681 aa  54.7  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  42.25 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  47.22 
 
 		 204 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  44.78 
 
 		 446 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  42.65 
 
 		 262 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16951  hypothetical protein  36.36 
 
 		 198 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.62237 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  51.52 
 
 		 745 aa  53.9  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  42.65 
 
 		 262 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0869  pentapeptide repeat protein  29.68 
 
 		 233 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0841759  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  56.67 
 
 		 277 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0823  pentapeptide repeat-containing protein  49.32 
 
 		 356 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000611936  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  40.85 
 
 		 315 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  46.03 
 
 		 489 aa  53.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  47.37 
 
 		 438 aa  53.5  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1857  pentapeptide repeat-containing protein  41.12 
 
 		 241 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899807  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4086  pentapeptide repeat-containing protein  34.58 
 
 		 1003 aa  53.1  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.791775  normal  0.807746 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  47.37 
 
 		 332 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  41.05 
 
 		 179 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1107  TPR repeat-containing protein  45.21 
 
 		 266 aa  53.5  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.684682  normal  0.836 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4358  pentapeptide repeat protein  51.52 
 
 		 152 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.748004 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  43.06 
 
 		 234 aa  53.1  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0369  pentapeptide repeat-containing protein  36.73 
 
 		 256 aa  53.1  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  39.06 
 
 		 267 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2500  pentapeptide repeat-containing protein  57.14 
 
 		 433 aa  53.1  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  56.14 
 
 		 292 aa  52.8  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  39.05 
 
 		 312 aa  52.8  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  50.82 
 
 		 286 aa  52.8  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0258  hypothetical protein  52.38 
 
 		 147 aa  52.4  0.000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  44.58 
 
 		 184 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  50.82 
 
 		 273 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  31.71 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  43.21 
 
 		 190 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  55.36 
 
 		 333 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2972  pentapeptide repeat protein  38.2 
 
 		 145 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>