More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2555 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2555  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
290 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000219025 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2406  pentapeptide repeat-containing protein  80 
 
 
288 aa  449  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584287  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5479  hypothetical protein  56.72 
 
 
279 aa  298  9e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0226407  decreased coverage  0.00750026 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3099  pentapeptide repeat-containing protein  44.85 
 
 
284 aa  264  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.240608  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3406  pentapeptide repeats domain protein  45.15 
 
 
273 aa  263  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3076  pentapeptide repeat-containing oxetanocin A resistance protein  44.24 
 
 
273 aa  262  4e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3159  pentapeptide repeat-containing oxetanocin A resistance protein  45.15 
 
 
273 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3394  pentapeptide repeats domain protein  45.15 
 
 
273 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4130  pentapeptide repeat-containing protein  54.28 
 
 
308 aa  262  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.745162  normal  0.353762 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2300  pentapeptide repeat-containing protein  54.84 
 
 
345 aa  261  6.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000752712  normal  0.0184634 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3175  pentapeptide repeat-containing protein  45.15 
 
 
273 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3425  pentapeptide repeat-containing protein  45.15 
 
 
273 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3381  pentapeptide repeats domain protein  44.78 
 
 
273 aa  261  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1850  pentapeptide repeats domain protein  44.78 
 
 
273 aa  260  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0691  hypothetical protein  56.65 
 
 
264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5548  pentapeptide repeat protein  53.96 
 
 
276 aa  253  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262169  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5950  pentapeptide repeat protein  51.14 
 
 
289 aa  247  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28820  uncharacterized low-complexity protein  51.88 
 
 
298 aa  245  6e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.190064 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07960  uncharacterized low-complexity protein  53.05 
 
 
286 aa  240  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0731853  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3741  pentapeptide repeat protein  50.54 
 
 
280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0057  pentapeptide repeat protein  48.73 
 
 
283 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2170  pentapeptide repeat protein  50.88 
 
 
296 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4358  pentapeptide repeat-containing protein  47.97 
 
 
264 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205207  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  46.73 
 
 
418 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  45.92 
 
 
361 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3404  pentapeptide repeat-containing protein  56.67 
 
 
60 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638482  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  48.81 
 
 
903 aa  72.4  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  40.74 
 
 
408 aa  71.2  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  44.44 
 
 
416 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  36.36 
 
 
442 aa  67  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  46.99 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  47.12 
 
 
411 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  45.54 
 
 
433 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  46.81 
 
 
143 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  51.32 
 
 
973 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  47.22 
 
 
340 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 
260 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 
263 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  47.62 
 
 
234 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  47.62 
 
 
234 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  51.39 
 
 
1033 aa  63.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  44.21 
 
 
204 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  55.38 
 
 
278 aa  63.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4134  pentapeptide repeat protein  43.48 
 
 
137 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.159468  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  48.91 
 
 
438 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1260  pentapeptide repeat-containing protein  47.13 
 
 
162 aa  63.2  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  hitchhiker  0.00173599 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  64.91 
 
 
184 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0869  pentapeptide repeat protein  30.56 
 
 
233 aa  62.4  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0841759  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  41.58 
 
 
256 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1862  hypothetical protein  44.87 
 
 
103 aa  61.2  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.833098  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  55.38 
 
 
277 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1857  pentapeptide repeat-containing protein  33.59 
 
 
241 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899807  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  40.4 
 
 
447 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  49.45 
 
 
299 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  47.14 
 
 
517 aa  60.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  53.23 
 
 
309 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4249  pentapeptide repeat-containing protein  43.53 
 
 
131 aa  60.1  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  43.02 
 
 
312 aa  60.1  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  54.29 
 
 
319 aa  60.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  44.44 
 
 
363 aa  60.1  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  30.95 
 
 
446 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  37.7 
 
 
447 aa  59.7  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5019  pentapeptide repeat-containing protein  45.45 
 
 
298 aa  59.3  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0997  pentapeptide repeat protein  30.56 
 
 
237 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0258  hypothetical protein  54.84 
 
 
147 aa  59.3  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4837  pentapeptide repeat-containing protein  45.68 
 
 
151 aa  59.3  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000291889  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  41.75 
 
 
216 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2944  pentapeptide repeat-containing protein  48.05 
 
 
172 aa  58.9  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.281269  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  54.93 
 
 
179 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  51.61 
 
 
255 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2673  serine/threonine protein kinase  44.71 
 
 
533 aa  58.5  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  43.75 
 
 
497 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  45.78 
 
 
331 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  46.24 
 
 
333 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0369  pentapeptide repeat-containing protein  40.86 
 
 
256 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  49.32 
 
 
214 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  45.95 
 
 
273 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  34.38 
 
 
245 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  53.33 
 
 
900 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  44.78 
 
 
567 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0523  pentapeptide repeat protein  55.56 
 
 
115 aa  58.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.567805  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  58.46 
 
 
286 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2559  pentapeptide repeat-containing protein  44.58 
 
 
163 aa  57.4  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 
521 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1882  hypothetical protein  54.05 
 
 
234 aa  57  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2086  hypothetical protein  55.56 
 
 
156 aa  57.4  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  52.46 
 
 
745 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  41.11 
 
 
386 aa  57.4  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4196  pentapeptide repeat protein  49.23 
 
 
261 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666213  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4156  pentapeptide repeat protein  49.23 
 
 
261 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  46.34 
 
 
381 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  37.25 
 
 
294 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.91 
 
 
14916 aa  57  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  44.94 
 
 
180 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  46.77 
 
 
234 aa  56.6  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  31.87 
 
 
450 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  35.21 
 
 
204 aa  56.2  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4620  pentapeptide repeat protein  48.24 
 
 
115 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0951  pentapeptide repeat protein  40.37 
 
 
393 aa  56.2  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1853  pentapeptide repeat protein  51.79 
 
 
369 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.150883  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>