More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1862 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1862  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  208  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.833098  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 		 361 aa  67.4  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5479  hypothetical protein  39.22 
 
 		 279 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0226407  decreased coverage  0.00750026 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5950  pentapeptide repeat protein  41.76 
 
 		 289 aa  64.7  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  42.71 
 
 		 381 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  36.08 
 
 		 416 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3076  pentapeptide repeat-containing oxetanocin A resistance protein  46.25 
 
 		 273 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3175  pentapeptide repeat-containing protein  46.25 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3159  pentapeptide repeat-containing oxetanocin A resistance protein  46.25 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3394  pentapeptide repeats domain protein  46.25 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  41.58 
 
 		 447 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3425  pentapeptide repeat-containing protein  46.25 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3406  pentapeptide repeats domain protein  46.25 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3381  pentapeptide repeats domain protein  46.25 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2559  pentapeptide repeat-containing protein  41.24 
 
 		 163 aa  62  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  40.86 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5310  pentapeptide repeat protein  51.43 
 
 		 264 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923126  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3099  pentapeptide repeat-containing protein  40.62 
 
 		 284 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.240608  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1850  pentapeptide repeats domain protein  40.62 
 
 		 273 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4130  pentapeptide repeat-containing protein  39.58 
 
 		 308 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.745162  normal  0.353762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2555  pentapeptide repeat-containing protein  44.87 
 
 		 290 aa  61.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000219025 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2406  pentapeptide repeat-containing protein  40.62 
 
 		 288 aa  60.8  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5019  pentapeptide repeat-containing protein  39.81 
 
 		 298 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2170  pentapeptide repeat protein  41.49 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  46.88 
 
 		 903 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  35.43 
 
 		 411 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  35.59 
 
 		 446 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0691  hypothetical protein  43.75 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1260  pentapeptide repeat-containing protein  36.11 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  hitchhiker  0.00173599 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4196  pentapeptide repeat protein  53.12 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4156  pentapeptide repeat protein  53.12 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0523  pentapeptide repeat protein  47.76 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.567805  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2141  pentapeptide repeat-containing protein  31.47 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07960  uncharacterized low-complexity protein  42.5 
 
 		 286 aa  57.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0731853  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  39.36 
 
 		 260 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1941  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  38.54 
 
 		 433 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 		 727 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1915  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  39.33 
 
 		 1033 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  42.11 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  34.43 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  46.15 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 		 386 aa  55.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  46.15 
 
 		 449 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2300  pentapeptide repeat-containing protein  40.4 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000752712  normal  0.0184634 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2064  serine/threonine protein kinase  40.79 
 
 		 540 aa  55.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28820  uncharacterized low-complexity protein  41.24 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.190064 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  35.92 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2440  pentapeptide repeat protein  42.03 
 
 		 830 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  39.22 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3670  pentapeptide repeat protein  42.11 
 
 		 830 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.414516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  43.37 
 
 		 600 aa  55.1  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  36.36 
 
 		 900 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2376  pentapeptide repeat-containing protein  39.13 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0340424 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1857  pentapeptide repeat-containing protein  35.64 
 
 		 241 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899807  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0205  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  37.86 
 
 		 537 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.47043 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  49.21 
 
 		 294 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  37.38 
 
 		 420 aa  52.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  40.62 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1117  pentapeptide repeat protein  49.23 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  39.53 
 
 		 266 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  44.93 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6262  pentapeptide repeat-containing protein  38.54 
 
 		 408 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104366  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  42.11 
 
 		 213 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2086  hypothetical protein  50 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0188  pentapeptide repeat-containing protein  38.1 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  47.06 
 
 		 309 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  43.08 
 
 		 824 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  39.08 
 
 		 517 aa  52.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5902  hypothetical protein  33.33 
 
 		 241 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  42.42 
 
 		 493 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  41.25 
 
 		 949 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3735  pentapeptide repeat-containing protein  48.44 
 
 		 206 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3741  pentapeptide repeat protein  42.5 
 
 		 280 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3786  pentapeptide repeat-containing protein  48.44 
 
 		 206 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0577  hypothetical protein  39.08 
 
 		 961 aa  52  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  43.94 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1728  pentapeptide repeat-containing protein  39.8 
 
 		 389 aa  52  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.952308  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  36.45 
 
 		 179 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  37.65 
 
 		 294 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  38.27 
 
 		 184 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  38.2 
 
 		 332 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  37.65 
 
 		 357 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0537  pentapeptide repeat-containing protein  41.67 
 
 		 959 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.884465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  46.88 
 
 		 320 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  47.76 
 
 		 489 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0951  pentapeptide repeat protein  46.88 
 
 		 393 aa  51.6  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  38.71 
 
 		 442 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  43.75 
 
 		 450 aa  51.6  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  50 
 
 		 184 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  47.14 
 
 		 419 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  41.05 
 
 		 222 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0810  pentapeptide repeat protein  37.97 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  37.78 
 
 		 1807 aa  50.8  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0783  pentapeptide repeat protein  37.97 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5006  pentapeptide repeat-containing protein  42.42 
 
 		 267 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4194  pentapeptide repeat protein  37.08 
 
 		 223 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1375  pentapeptide repeat protein  36.59 
 
 		 514 aa  50.8  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  33.91 
 
 		 312 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>