More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5310 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5310  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 264 aa  489  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923126  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5006  pentapeptide repeat-containing protein  81.4 
 
 		 267 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4774  pentapeptide repeat-containing protein  55.23 
 
 		 266 aa  237  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0995  pentapeptide repeat protein  53.42 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0411427 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  39.63 
 
 		 517 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  40.09 
 
 		 521 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  39.9 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  41.24 
 
 		 493 aa  97.8  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  42.65 
 
 		 332 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  41.2 
 
 		 386 aa  96.3  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  41.1 
 
 		 449 aa  95.9  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  43.81 
 
 		 309 aa  95.5  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  39.2 
 
 		 264 aa  95.5  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  39.09 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  40.66 
 
 		 294 aa  92  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  35.71 
 
 		 320 aa  92  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  35.34 
 
 		 862 aa  92  9e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  40.43 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  44.5 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  33.61 
 
 		 268 aa  90.5  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  39.34 
 
 		 389 aa  90.9  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  39.81 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  37.67 
 
 		 340 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  43.72 
 
 		 351 aa  90.5  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  36.36 
 
 		 336 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  36.36 
 
 		 336 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  47.67 
 
 		 1033 aa  89.7  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  41.18 
 
 		 433 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  35.77 
 
 		 1191 aa  89  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  40.91 
 
 		 576 aa  88.2  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  43.09 
 
 		 184 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  39.37 
 
 		 343 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  39.05 
 
 		 493 aa  87  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  41.44 
 
 		 745 aa  87  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  39.37 
 
 		 343 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  44.15 
 
 		 416 aa  86.3  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  33.48 
 
 		 381 aa  86.3  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  38.57 
 
 		 273 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  40 
 
 		 286 aa  85.9  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  40.54 
 
 		 489 aa  85.5  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  37.86 
 
 		 300 aa  85.5  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  42.44 
 
 		 216 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  41.88 
 
 		 199 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  40.49 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  39.15 
 
 		 441 aa  84.3  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  37.31 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  43.72 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  36.92 
 
 		 174 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  39.23 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  41.58 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  35.47 
 
 		 401 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  37.77 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  35.47 
 
 		 401 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  35.86 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  41.36 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  40.56 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  36.41 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  40.78 
 
 		 567 aa  82.4  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  40.72 
 
 		 203 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.83 
 
 		 14916 aa  81.6  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1585  pentapeptide repeat-containing protein  39.51 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000106738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  38.58 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  40.37 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  37.63 
 
 		 515 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  38.21 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  36.26 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  42.59 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  36.18 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  39.02 
 
 		 452 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  37.89 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  39.62 
 
 		 776 aa  79  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  37 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2330  pentapeptide repeat protein  36.07 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229245 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  34.95 
 
 		 872 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0477  pentapeptide repeat protein  39.52 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  32.38 
 
 		 448 aa  78.6  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  37.85 
 
 		 175 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  30.08 
 
 		 600 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  37 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  38.38 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  37.71 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  37.71 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  35.05 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  37.71 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  39.48 
 
 		 870 aa  77.8  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  31.44 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  34.98 
 
 		 401 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  34.74 
 
 		 877 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  30.09 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  33.19 
 
 		 419 aa  76.3  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  39.67 
 
 		 485 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  36.32 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 		 418 aa  76.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  38.59 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  36.09 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  40.7 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  40.7 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  35.83 
 
 		 706 aa  75.9  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  34.48 
 
 		 401 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>