More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4130 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4130  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 308 aa  620  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.745162  normal  0.353762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5479  hypothetical protein  63.6 
 
 		 279 aa  344  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0226407  decreased coverage  0.00750026 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3394  pentapeptide repeats domain protein  51.87 
 
 		 273 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3159  pentapeptide repeat-containing oxetanocin A resistance protein  51.87 
 
 		 273 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1850  pentapeptide repeats domain protein  52.24 
 
 		 273 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3175  pentapeptide repeat-containing protein  51.49 
 
 		 273 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3406  pentapeptide repeats domain protein  52.26 
 
 		 273 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3425  pentapeptide repeat-containing protein  51.49 
 
 		 273 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3099  pentapeptide repeat-containing protein  50.53 
 
 		 284 aa  300  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.240608  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3381  pentapeptide repeats domain protein  51.87 
 
 		 273 aa  299  4e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3076  pentapeptide repeat-containing oxetanocin A resistance protein  51.31 
 
 		 273 aa  297  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2406  pentapeptide repeat-containing protein  57.84 
 
 		 288 aa  292  5e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2300  pentapeptide repeat-containing protein  57.51 
 
 		 345 aa  280  3e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000752712  normal  0.0184634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5950  pentapeptide repeat protein  54.96 
 
 		 289 aa  279  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2555  pentapeptide repeat-containing protein  54.28 
 
 		 290 aa  273  3e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000219025 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5548  pentapeptide repeat protein  53.03 
 
 		 276 aa  259  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262169  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3741  pentapeptide repeat protein  53.01 
 
 		 280 aa  259  4e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07960  uncharacterized low-complexity protein  53.79 
 
 		 286 aa  250  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0731853  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28820  uncharacterized low-complexity protein  52.11 
 
 		 298 aa  249  4e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.190064 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0691  hypothetical protein  52.67 
 
 		 264 aa  248  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2170  pentapeptide repeat protein  52.98 
 
 		 296 aa  236  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0057  pentapeptide repeat protein  47.06 
 
 		 283 aa  215  8e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4358  pentapeptide repeat-containing protein  44.66 
 
 		 264 aa  186  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205207  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  33.47 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3404  pentapeptide repeat-containing protein  48 
 
 		 60 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638482  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  48.35 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1260  pentapeptide repeat-containing protein  40.85 
 
 		 162 aa  67.8  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  hitchhiker  0.00173599 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  47.96 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  60.34 
 
 		 900 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  46.32 
 
 		 973 aa  63.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  47.25 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  51.32 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5019  pentapeptide repeat-containing protein  45.05 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  59.65 
 
 		 1033 aa  63.2  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  51.32 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  48.86 
 
 		 441 aa  63.2  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  50 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  50 
 
 		 903 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2944  pentapeptide repeat-containing protein  48 
 
 		 172 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.281269  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  48.48 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0205  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  43.75 
 
 		 537 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.47043 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  45.68 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  55.56 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  37.04 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1862  hypothetical protein  39.58 
 
 		 103 aa  61.6  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.833098  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0188  pentapeptide repeat-containing protein  46.99 
 
 		 99 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  48 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0258  hypothetical protein  57.14 
 
 		 147 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  41.18 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  43.9 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  34.09 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3786  pentapeptide repeat-containing protein  68 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3735  pentapeptide repeat-containing protein  68 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  38.38 
 
 		 447 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2086  hypothetical protein  61.11 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  47.06 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  43.14 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  38.52 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0369  pentapeptide repeat-containing protein  40.78 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  41.3 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  35.29 
 
 		 447 aa  59.3  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  40.19 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  37.41 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  44.16 
 
 		 517 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  36 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  48.57 
 
 		 862 aa  58.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  44.44 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  36.8 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  44.71 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  50 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  44.3 
 
 		 343 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  57.41 
 
 		 143 aa  57  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3010  pentapeptide repeat protein  49.37 
 
 		 233 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  44.3 
 
 		 343 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  52.38 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  52.24 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4837  pentapeptide repeat-containing protein  59.26 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000291889  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2505  pentapeptide repeat protein  33.1 
 
 		 371 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  53.62 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0823  pentapeptide repeat-containing protein  46.67 
 
 		 356 aa  55.8  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000611936  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2972  pentapeptide repeat protein  45.95 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  35.77 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  55 
 
 		 340 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  46.05 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0207  pentapeptide repeat protein  60 
 
 		 247 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000258172  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  58.62 
 
 		 438 aa  55.8  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  30.3 
 
 		 450 aa  55.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  35.56 
 
 		 734 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 		 182 aa  55.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  60.78 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  45.71 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3601  pentapeptide repeat protein  32.62 
 
 		 371 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  44.29 
 
 		 521 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  56.14 
 
 		 218 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  51.35 
 
 		 862 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  55.36 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4620  pentapeptide repeat protein  55.36 
 
 		 115 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  37.36 
 
 		 259 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  40.95 
 
 		 449 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>