275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0188 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0188  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 99 aa  196  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2170  pentapeptide repeat protein  50.6 
 
 		 296 aa  67  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0691  hypothetical protein  46.99 
 
 		 264 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4130  pentapeptide repeat-containing protein  46.99 
 
 		 308 aa  60.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.745162  normal  0.353762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5950  pentapeptide repeat protein  48.72 
 
 		 289 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4156  pentapeptide repeat protein  40.62 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  55.93 
 
 		 1033 aa  58.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28820  uncharacterized low-complexity protein  46.91 
 
 		 298 aa  58.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.190064 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4196  pentapeptide repeat protein  40.62 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  42.7 
 
 		 449 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1260  pentapeptide repeat-containing protein  42.16 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  hitchhiker  0.00173599 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  54.55 
 
 		 389 aa  55.8  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5548  pentapeptide repeat protein  46.15 
 
 		 276 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262169  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  40.86 
 
 		 222 aa  54.3  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2772  pentapeptide repeat-containing protein  43.9 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  48.39 
 
 		 259 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  46.25 
 
 		 320 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  53.57 
 
 		 278 aa  53.9  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2406  pentapeptide repeat-containing protein  48.61 
 
 		 288 aa  53.9  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  42.11 
 
 		 225 aa  53.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  46.25 
 
 		 184 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1862  hypothetical protein  38.1 
 
 		 103 aa  52.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.833098  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  47.37 
 
 		 447 aa  53.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  42.35 
 
 		 493 aa  53.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5479  hypothetical protein  46.15 
 
 		 279 aa  52.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0226407  decreased coverage  0.00750026 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 		 260 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  40.91 
 
 		 256 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27891  hypothetical protein  54.1 
 
 		 288 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3786  pentapeptide repeat-containing protein  50.72 
 
 		 206 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3735  pentapeptide repeat-containing protein  50.72 
 
 		 206 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  45.33 
 
 		 277 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  38.3 
 
 		 168 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3099  pentapeptide repeat-containing protein  38.27 
 
 		 284 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.240608  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2987  pentapeptide repeat protein  50 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3381  pentapeptide repeats domain protein  38.27 
 
 		 273 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  43.04 
 
 		 245 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  43.96 
 
 		 973 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1850  pentapeptide repeats domain protein  38.27 
 
 		 273 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3406  pentapeptide repeats domain protein  38.27 
 
 		 273 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3175  pentapeptide repeat-containing protein  38.27 
 
 		 273 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3076  pentapeptide repeat-containing oxetanocin A resistance protein  39.74 
 
 		 273 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4358  pentapeptide repeat protein  36.73 
 
 		 152 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.748004 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3425  pentapeptide repeat-containing protein  38.27 
 
 		 273 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3394  pentapeptide repeats domain protein  38.27 
 
 		 273 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3159  pentapeptide repeat-containing oxetanocin A resistance protein  39.74 
 
 		 273 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  44.44 
 
 		 199 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  42.31 
 
 		 286 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  44.44 
 
 		 199 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3741  pentapeptide repeat protein  43.53 
 
 		 280 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  38.27 
 
 		 886 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2555  pentapeptide repeat-containing protein  45.83 
 
 		 290 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000219025 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  43.42 
 
 		 450 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07960  uncharacterized low-complexity protein  41.57 
 
 		 286 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0731853  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  44.78 
 
 		 219 aa  48.9  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  41.54 
 
 		 262 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  47.83 
 
 		 1901 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  41.54 
 
 		 262 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  42.25 
 
 		 273 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  41.25 
 
 		 517 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  46.03 
 
 		 567 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.12 
 
 		 14916 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  54.72 
 
 		 299 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  40.79 
 
 		 862 aa  48.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  37.36 
 
 		 420 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4923  Serine/threonine protein kinase  36.73 
 
 		 524 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1987  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  36.36 
 
 		 497 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5310  pentapeptide repeat protein  50 
 
 		 264 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923126  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4358  pentapeptide repeat-containing protein  42.31 
 
 		 264 aa  47.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205207  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  45 
 
 		 825 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 		 489 aa  47  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  38.89 
 
 		 187 aa  47  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5019  pentapeptide repeat-containing protein  39.77 
 
 		 298 aa  47  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  46.58 
 
 		 862 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  42.31 
 
 		 255 aa  47  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0386  pentapeptide repeat protein  40.35 
 
 		 509 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  32.98 
 
 		 362 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  41.03 
 
 		 182 aa  46.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0686  pentapeptide repeat-containing protein  38.96 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0322373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1585  pentapeptide repeat-containing protein  57.78 
 
 		 237 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000106738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  39.74 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2759  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  43.48 
 
 		 576 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  42.31 
 
 		 438 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4249  pentapeptide repeat-containing protein  36.71 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  44.83 
 
 		 267 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3546  pentapeptide repeat-containing protein  61.36 
 
 		 293 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000394958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  43.94 
 
 		 442 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2141  pentapeptide repeat-containing protein  44.44 
 
 		 222 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2300  pentapeptide repeat-containing protein  45.33 
 
 		 345 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000752712  normal  0.0184634 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  43.08 
 
 		 184 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  41.11 
 
 		 441 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2559  pentapeptide repeat-containing protein  35.45 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  47.3 
 
 		 825 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  50.94 
 
 		 215 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2944  pentapeptide repeat-containing protein  48.28 
 
 		 172 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.281269  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  45.16 
 
 		 343 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  42.11 
 
 		 870 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0195  hypothetical protein  42.27 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.673966 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  39.08 
 
 		 241 aa  45.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>