More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0386 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0386  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
509 aa  1032    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2972  pentapeptide repeat protein  44.57 
 
 
145 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  51.47 
 
 
255 aa  67  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  48.1 
 
 
900 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  52.86 
 
 
356 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0783  pentapeptide repeat protein  47.5 
 
 
149 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0810  pentapeptide repeat protein  47.5 
 
 
149 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3786  pentapeptide repeat-containing protein  55.93 
 
 
206 aa  65.1  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3735  pentapeptide repeat-containing protein  55.93 
 
 
206 aa  65.1  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4156  pentapeptide repeat protein  57.63 
 
 
261 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4196  pentapeptide repeat protein  57.63 
 
 
261 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666213  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4620  pentapeptide repeat protein  46.15 
 
 
115 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  51.43 
 
 
356 aa  63.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2376  pentapeptide repeat-containing protein  47.44 
 
 
167 aa  63.9  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0340424 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  51.47 
 
 
331 aa  63.9  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  43.75 
 
 
256 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  26.87 
 
 
521 aa  63.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  32.9 
 
 
1191 aa  63.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5548  pentapeptide repeat protein  35.82 
 
 
276 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262169  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  64 
 
 
264 aa  62.4  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  43.18 
 
 
340 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  51.61 
 
 
184 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0369  pentapeptide repeat-containing protein  41.24 
 
 
256 aa  61.6  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2086  hypothetical protein  52.63 
 
 
156 aa  61.6  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  44.16 
 
 
1033 aa  61.6  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4837  pentapeptide repeat-containing protein  56.14 
 
 
151 aa  62  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000291889  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  55.17 
 
 
168 aa  61.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  43.21 
 
 
225 aa  60.8  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  31.97 
 
 
263 aa  60.5  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2937  hypothetical protein  40.7 
 
 
393 aa  60.5  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.807989  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2939  pentapeptide repeat protein  47.89 
 
 
145 aa  60.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3157  pentapeptide repeat protein  47.89 
 
 
145 aa  60.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.400577  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  46.15 
 
 
234 aa  60.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  46.15 
 
 
234 aa  60.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2944  pentapeptide repeat-containing protein  57.69 
 
 
172 aa  60.5  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.281269  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0258  hypothetical protein  47.89 
 
 
147 aa  60.1  0.00000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  46.88 
 
 
259 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  48.61 
 
 
266 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1101  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 
240 aa  60.1  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.233606  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0195  hypothetical protein  50.85 
 
 
142 aa  60.1  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.673966 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  36.19 
 
 
483 aa  59.7  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  50.77 
 
 
493 aa  59.3  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  52.63 
 
 
245 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  52.38 
 
 
381 aa  59.3  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  52.46 
 
 
286 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5310  pentapeptide repeat protein  47.76 
 
 
264 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923126  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  56.52 
 
 
14916 aa  58.9  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0870  pentapeptide repeat protein  52.63 
 
 
362 aa  58.2  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3874  pentapeptide repeat protein  41.25 
 
 
152 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  55 
 
 
206 aa  58.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  44.94 
 
 
267 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  36.79 
 
 
412 aa  58.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2987  pentapeptide repeat protein  43.02 
 
 
130 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  56 
 
 
903 aa  58.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  51.72 
 
 
143 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  43.48 
 
 
260 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3923  pentapeptide repeat protein  41.25 
 
 
167 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0131528  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  52.54 
 
 
182 aa  57.8  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  53.45 
 
 
184 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4774  pentapeptide repeat-containing protein  47.06 
 
 
266 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  48.05 
 
 
447 aa  57.4  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
418 aa  57.4  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  56.86 
 
 
194 aa  57.4  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  36 
 
 
179 aa  57.4  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3010  pentapeptide repeat protein  50.77 
 
 
233 aa  57  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  52.73 
 
 
576 aa  56.6  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  37.63 
 
 
165 aa  56.6  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0475  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
204 aa  56.6  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.019443 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  48.44 
 
 
386 aa  56.6  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1435  pentapeptide repeat protein  33.73 
 
 
400 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  34.2 
 
 
320 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0250  hypothetical protein  42.86 
 
 
155 aa  56.6  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  55.56 
 
 
267 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 
309 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 
278 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  52.54 
 
 
315 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  47.46 
 
 
1901 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  52.63 
 
 
357 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  40.37 
 
 
210 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  53.97 
 
 
449 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  46.15 
 
 
1831 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  46.27 
 
 
250 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2406  pentapeptide repeat-containing protein  32.23 
 
 
288 aa  55.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584287  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2555  pentapeptide repeat-containing protein  32.79 
 
 
290 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000219025 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1107  TPR repeat-containing protein  57.45 
 
 
266 aa  55.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.684682  normal  0.836 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  52.46 
 
 
180 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  49.12 
 
 
343 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  37.66 
 
 
517 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  49.12 
 
 
343 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  53.97 
 
 
294 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0686  pentapeptide repeat-containing protein  54.39 
 
 
152 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0322373  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  50.75 
 
 
199 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4130  pentapeptide repeat-containing protein  50.85 
 
 
308 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.745162  normal  0.353762 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  35.71 
 
 
256 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2673  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
533 aa  55.1  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  47.76 
 
 
273 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  46.58 
 
 
203 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27891  hypothetical protein  49.18 
 
 
288 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1164  hypothetical protein  42.17 
 
 
291 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.919275 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  37.65 
 
 
825 aa  54.7  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>