More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2939 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2939  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
145 aa  289  8e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3157  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
145 aa  289  8e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.400577  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2972  pentapeptide repeat protein  70.83 
 
 
145 aa  201  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0783  pentapeptide repeat protein  68.75 
 
 
149 aa  185  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0810  pentapeptide repeat protein  68.75 
 
 
149 aa  185  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4837  pentapeptide repeat-containing protein  59.44 
 
 
151 aa  163  5.9999999999999996e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000291889  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0686  pentapeptide repeat-containing protein  60 
 
 
152 aa  145  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0322373  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0195  hypothetical protein  57.85 
 
 
142 aa  133  9e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.673966 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  41.98 
 
 
259 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0258  hypothetical protein  44.76 
 
 
147 aa  93.2  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  39.69 
 
 
256 aa  89.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2086  hypothetical protein  39.72 
 
 
156 aa  84.7  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  39.06 
 
 
401 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  39.06 
 
 
401 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  43.24 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  39.57 
 
 
225 aa  81.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  39.69 
 
 
255 aa  81.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4196  pentapeptide repeat protein  41.94 
 
 
261 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666213  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4156  pentapeptide repeat protein  41.94 
 
 
261 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  45.26 
 
 
1033 aa  81.3  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  38.46 
 
 
190 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  41.07 
 
 
241 aa  80.5  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0369  pentapeptide repeat-containing protein  37.4 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0250  hypothetical protein  36.3 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  38.26 
 
 
401 aa  77.4  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  38.26 
 
 
401 aa  77.4  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  38.93 
 
 
222 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1107  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.684682  normal  0.836 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  43.75 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3522  pentapeptide repeat-containing protein  35.97 
 
 
168 aa  73.9  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.894088  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  37.6 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24671  hypothetical protein  45.83 
 
 
102 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27891  hypothetical protein  35.66 
 
 
288 aa  71.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4358  pentapeptide repeat protein  43.64 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.748004 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  39.47 
 
 
521 aa  70.1  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  42.72 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  40.91 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  42.42 
 
 
973 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  42.86 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2985  pentapeptide repeat protein  37.21 
 
 
222 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  39.13 
 
 
447 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  34.75 
 
 
497 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  37.93 
 
 
332 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  42.42 
 
 
517 aa  67  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3134  pentapeptide repeat protein  37.21 
 
 
222 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  41 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  41 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  34.48 
 
 
900 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  41.58 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  41.94 
 
 
745 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  40.54 
 
 
433 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1260  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  hitchhiker  0.00173599 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  41.94 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  42.5 
 
 
903 aa  65.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  40.78 
 
 
263 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  43.48 
 
 
493 aa  65.5  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  39.58 
 
 
447 aa  65.5  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  45.98 
 
 
416 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  40 
 
 
309 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0521  hypothetical protein  40.21 
 
 
195 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  41.98 
 
 
1191 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  47.13 
 
 
278 aa  65.5  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  35.2 
 
 
245 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3786  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 
206 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  38.26 
 
 
267 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  38.61 
 
 
194 aa  64.7  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3735  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 
206 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  41.41 
 
 
567 aa  64.3  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  38.89 
 
 
824 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  41.76 
 
 
180 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0475  pentapeptide repeat-containing protein  45.1 
 
 
204 aa  64.3  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.019443 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  40.43 
 
 
446 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  38.78 
 
 
214 aa  63.9  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  40.62 
 
 
213 aa  63.9  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0058  pentapeptide repeat-containing protein  32.62 
 
 
205 aa  63.9  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108417  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  40.78 
 
 
299 aa  63.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1263  hypothetical protein  33.86 
 
 
169 aa  63.5  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  30.43 
 
 
440 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  38.83 
 
 
250 aa  63.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  38.61 
 
 
1831 aa  63.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  36.7 
 
 
361 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  42.55 
 
 
260 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  39.22 
 
 
320 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 
340 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  38.71 
 
 
174 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2291  hypothetical protein  33.64 
 
 
365 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0775084 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2272  pentapeptide repeat-containing protein  33.87 
 
 
681 aa  62.8  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  35.79 
 
 
294 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  36.63 
 
 
449 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  43.18 
 
 
386 aa  62.4  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0192  pentapeptide repeat-containing protein  35.24 
 
 
181 aa  62  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.493873  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1728  pentapeptide repeat-containing protein  35.59 
 
 
389 aa  62  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.952308  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  46.34 
 
 
184 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3074  putative signal transduction protein with Nacht domain  36.25 
 
 
851 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.39797e-24 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  38.14 
 
 
215 aa  60.8  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  44.16 
 
 
1901 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2678  pentapeptide repeat-containing protein  42.27 
 
 
168 aa  61.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 
576 aa  61.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  38.04 
 
 
489 aa  60.8  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  38.89 
 
 
319 aa  61.2  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>