More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1273 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 206 aa  402  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  53.85 
 
 		 204 aa  190  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13397  hypothetical protein  51.96 
 
 		 183 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.102743 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  49.73 
 
 		 186 aa  164  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  50.28 
 
 		 183 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  48.88 
 
 		 183 aa  161  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  48.88 
 
 		 183 aa  161  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  48.88 
 
 		 183 aa  161  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  47.85 
 
 		 218 aa  152  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  41.3 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  38.69 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  39.89 
 
 		 193 aa  125  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  35.18 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  38.17 
 
 		 197 aa  117  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  31.12 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  34.85 
 
 		 206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  37.7 
 
 		 191 aa  101  8e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 205 aa  99.4  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  36.55 
 
 		 493 aa  97.4  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  34.17 
 
 		 198 aa  94  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  31.12 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  32.93 
 
 		 521 aa  81.3  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  30.35 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  34.52 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  32.79 
 
 		 517 aa  77  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  30 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  30.54 
 
 		 449 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  31.22 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  32.03 
 
 		 567 aa  76.3  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  32.14 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18320  uncharacterized low-complexity protein  34.41 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  30.77 
 
 		 242 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  32.52 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  30.23 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  32.31 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  32.43 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  33.72 
 
 		 862 aa  72.8  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  30.21 
 
 		 214 aa  72  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  29.78 
 
 		 215 aa  72  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  29.2 
 
 		 1191 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  30 
 
 		 286 aa  71.6  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  28.18 
 
 		 600 aa  71.2  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  31.52 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  28.9 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  29.38 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4759  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.65 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  32.03 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  29.14 
 
 		 776 aa  70.5  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  32.28 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  34.69 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  32.16 
 
 		 903 aa  69.7  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0864  heat shock protein DnaJ-like  39.06 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3552  pentapeptide repeat-containing protein  32.52 
 
 		 415 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  29.71 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3289  pentapeptide repeat containing protein  25.82 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.051928  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  29.52 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  29.71 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  30.2 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  31.54 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  26.01 
 
 		 844 aa  67  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  27.81 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  30.25 
 
 		 493 aa  66.2  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  28.49 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  28.78 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  35.9 
 
 		 420 aa  65.9  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  29.34 
 
 		 745 aa  66.2  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  26.25 
 
 		 401 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  26.25 
 
 		 401 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  30.11 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  31.25 
 
 		 319 aa  65.5  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  26.29 
 
 		 312 aa  65.1  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  29.94 
 
 		 332 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  44.58 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  27.78 
 
 		 448 aa  65.1  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  53.03 
 
 		 259 aa  65.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  29.56 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 419 aa  65.1  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  29.21 
 
 		 442 aa  64.7  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5310  pentapeptide repeat protein  35.71 
 
 		 264 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923126  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  34.66 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  31.18 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  23.24 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  31.14 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  29.94 
 
 		 576 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2153  pentapeptide repeat-containing protein  37.04 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.281285  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2937  hypothetical protein  36.7 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.807989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  30.25 
 
 		 1033 aa  63.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  31.65 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.75 
 
 		 14916 aa  63.5  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  28 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  31.4 
 
 		 355 aa  62.8  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  27.75 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  35.91 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  29.55 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  30 
 
 		 453 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  29.03 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  32.1 
 
 		 343 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  32.1 
 
 		 343 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  30.73 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3960  pentapeptide repeat-containing protein  28.86 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>