More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2222 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 243 aa  478  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3960  pentapeptide repeat-containing protein  38.61 
 
 		 229 aa  122  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  38.67 
 
 		 224 aa  112  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  39.49 
 
 		 232 aa  111  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  34.07 
 
 		 242 aa  111  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  34.98 
 
 		 242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  33.19 
 
 		 233 aa  108  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18320  uncharacterized low-complexity protein  35.24 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  34.76 
 
 		 1191 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  35.79 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  35.79 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  35.79 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  35.53 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  33.04 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  30 
 
 		 710 aa  74.7  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  34.78 
 
 		 452 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  32.31 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  32.78 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  29.76 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  32.78 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  32.16 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  32.82 
 
 		 567 aa  73.2  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  30.53 
 
 		 381 aa  71.6  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  27.98 
 
 		 340 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  33.18 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  33.68 
 
 		 515 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  34.02 
 
 		 872 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  33.71 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  28.93 
 
 		 734 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  26.84 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  29.33 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  32.42 
 
 		 351 aa  68.9  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  31.25 
 
 		 576 aa  68.9  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  34.8 
 
 		 449 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  31.96 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  33.7 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  27.78 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  28.23 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  31.96 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  33.82 
 
 		 485 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  35.5 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  28.05 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  29.27 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  30.05 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  33.14 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  33.68 
 
 		 880 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  26.7 
 
 		 200 aa  67  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  33.68 
 
 		 880 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  33.14 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  32.16 
 
 		 214 aa  67  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  33.68 
 
 		 880 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  33.68 
 
 		 880 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  26.72 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  25 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  30.25 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13397  hypothetical protein  32 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.102743 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  30.05 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  29.03 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.04 
 
 		 14916 aa  66.2  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  29.63 
 
 		 521 aa  65.9  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  30.32 
 
 		 401 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  29 
 
 		 360 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  28.22 
 
 		 363 aa  65.5  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  33.16 
 
 		 877 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  27.71 
 
 		 333 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  30.1 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  29.24 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  32.98 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  29 
 
 		 360 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  28.44 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  29 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  33.01 
 
 		 456 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  32.26 
 
 		 880 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  30.14 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  29 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  31.44 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  29 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  29 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  29.87 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2330  pentapeptide repeat protein  28.18 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  26.24 
 
 		 440 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  28.06 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  33.77 
 
 		 1033 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  35.71 
 
 		 433 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  31.31 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  27.98 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  32.84 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  33.76 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  29.95 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  30.68 
 
 		 706 aa  62.8  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000904  hypothetical protein  26.67 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  30.89 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  30.39 
 
 		 447 aa  62.8  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  29.03 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  33.81 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  30 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  30.65 
 
 		 862 aa  62.4  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  30.67 
 
 		 745 aa  62  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  28.96 
 
 		 241 aa  62  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2059  pentapeptide repeat-containing protein  26.57 
 
 		 214 aa  62  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361738  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>