More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2059 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2059  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 214 aa  439  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0911  pentapeptide repeat protein  61.95 
 
 		 215 aa  270  9e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545668 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  50 
 
 		 218 aa  189  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2102  hypothetical protein  47.42 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000904  hypothetical protein  43.13 
 
 		 216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  43.54 
 
 		 218 aa  181  6e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  44.85 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  41.71 
 
 		 216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  41.83 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3692  pentapeptide repeat-containing protein  47.42 
 
 		 218 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.413415  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  43.08 
 
 		 223 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  24.62 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  27.09 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  26.41 
 
 		 449 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  27.37 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  25.54 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  24.76 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  29.89 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  28.74 
 
 		 456 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  27.57 
 
 		 493 aa  65.9  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  25.4 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  28.49 
 
 		 453 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  25 
 
 		 340 aa  65.1  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  27.59 
 
 		 485 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  23.63 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  26.98 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  29.63 
 
 		 870 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  26.13 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  29.55 
 
 		 452 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  24.65 
 
 		 1191 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  25.97 
 
 		 567 aa  62.8  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  28.99 
 
 		 862 aa  63.5  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  25.24 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  30.07 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  26.4 
 
 		 576 aa  62  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  26.57 
 
 		 243 aa  62  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  27.36 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  23.73 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  27.32 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  24.39 
 
 		 727 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  28.07 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  31.9 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  26.42 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  26.42 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  29.66 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  26.11 
 
 		 844 aa  59.7  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  27.36 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  26.42 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  24.26 
 
 		 489 aa  59.3  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  25.25 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0440  pentapeptide repeat-containing protein  26.09 
 
 		 601 aa  58.9  0.00000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  26.76 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  26.29 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  26.29 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  23.44 
 
 		 872 aa  59.3  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  26.42 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  24.76 
 
 		 862 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  23.71 
 
 		 866 aa  58.9  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  24.76 
 
 		 825 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  25.35 
 
 		 517 aa  58.5  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1751  pentapeptide repeat-containing protein  25.97 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00861009  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  24.86 
 
 		 309 aa  58.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  29.45 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  24.76 
 
 		 825 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  24.76 
 
 		 825 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2126  pentapeptide repeat-containing protein  21.8 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  24.76 
 
 		 825 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  24.76 
 
 		 825 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  25.87 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  24.63 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  28.42 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  25.82 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  25.35 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  25.82 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  22.34 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  24.34 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  25.7 
 
 		 880 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  25.56 
 
 		 363 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  31.76 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  25.58 
 
 		 264 aa  57  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  25.7 
 
 		 880 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  27 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  25.7 
 
 		 880 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  25.29 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  25.7 
 
 		 880 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  27.04 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  25.94 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2985  pentapeptide repeat protein  27.37 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  24.27 
 
 		 825 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  25.93 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  23.03 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  25.94 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  25.7 
 
 		 880 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  25.44 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  26.96 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  24.55 
 
 		 877 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  25.22 
 
 		 872 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  23.37 
 
 		 348 aa  55.1  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  22.55 
 
 		 291 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  22.55 
 
 		 291 aa  55.1  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>