More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0911 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0911  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 215 aa  445  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545668 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2059  pentapeptide repeat-containing protein  61.95 
 
 		 214 aa  270  9e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  48.17 
 
 		 218 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2102  hypothetical protein  43.46 
 
 		 217 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  41.88 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3692  pentapeptide repeat-containing protein  47.89 
 
 		 218 aa  161  7e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.413415  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000904  hypothetical protein  42.11 
 
 		 216 aa  159  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  41.27 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  41.05 
 
 		 216 aa  159  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  38.65 
 
 		 218 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  42.33 
 
 		 223 aa  147  9e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  26.73 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  28.57 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  29.06 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  26.5 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  32.37 
 
 		 870 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  28.65 
 
 		 872 aa  69.3  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  29.06 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  24.04 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  25.88 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  27.37 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  27.57 
 
 		 449 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  27.37 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  25.37 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  27.66 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  25.38 
 
 		 734 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  29.07 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  26.42 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  29.07 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  26.42 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  24.14 
 
 		 340 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  24.1 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  29.44 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  25.29 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  28.41 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  24.85 
 
 		 489 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  25.59 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  25.79 
 
 		 521 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2126  pentapeptide repeat-containing protein  22.27 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  28.73 
 
 		 949 aa  63.5  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  29.65 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  28.31 
 
 		 456 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  26.44 
 
 		 517 aa  63.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  25.14 
 
 		 493 aa  63.2  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  25.95 
 
 		 355 aa  63.2  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  25.14 
 
 		 567 aa  62.8  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  29.65 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1181  pentapeptide repeat protein  26.63 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.329473 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  28.9 
 
 		 844 aa  62  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  27.12 
 
 		 452 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  25.26 
 
 		 182 aa  62  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  27.94 
 
 		 311 aa  62  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  23.61 
 
 		 197 aa  62  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  28.25 
 
 		 453 aa  62  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  29.89 
 
 		 710 aa  61.6  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  25.39 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18320  uncharacterized low-complexity protein  27.62 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  27.41 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  26.17 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  24.86 
 
 		 493 aa  61.2  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  29.17 
 
 		 862 aa  60.8  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  25.99 
 
 		 485 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  28.57 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  27 
 
 		 727 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  27.27 
 
 		 448 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  24.62 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  25.75 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  25.14 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  24.06 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  23.29 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  26.32 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  24.44 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  25.23 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  27.74 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  25.35 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  25.6 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  25 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  27.09 
 
 		 359 aa  58.5  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 862 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  27.98 
 
 		 1191 aa  58.5  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  23.76 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  25.23 
 
 		 370 aa  58.5  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  35.09 
 
 		 903 aa  58.5  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  25.39 
 
 		 348 aa  58.5  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  24.32 
 
 		 263 aa  58.5  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  26.86 
 
 		 241 aa  58.2  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 825 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  25.95 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  26.97 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  26.97 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 825 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 825 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 825 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 825 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2673  pentapeptide repeat-containing protein  24.38 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  24.06 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  25.41 
 
 		 576 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  22.78 
 
 		 483 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  27.32 
 
 		 872 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  26.7 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.655293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>