More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1896 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  39.83 
 
 
229 aa  160  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  35.5 
 
 
229 aa  138  7.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3302  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 
225 aa  132  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5828  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 
189 aa  97.1  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510799  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5595  pentapeptide repeat protein  28.89 
 
 
221 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6181  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.309204  normal  0.0469485 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  23.33 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  23.72 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  23.33 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  24.19 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  23.33 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  31.25 
 
 
193 aa  72  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  24.83 
 
 
190 aa  71.6  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  25.65 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  23.25 
 
 
227 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  23.72 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  31.25 
 
 
193 aa  68.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  21.69 
 
 
213 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1295  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  28.05 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75651  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  29.23 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35000  uncharacterized low-complexity protein  26.06 
 
 
216 aa  64.7  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2466  pentapeptide repeat-containing protein  25.95 
 
 
220 aa  64.3  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1028  pentapeptide repeat-containing protein  29.01 
 
 
180 aa  63.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.22421  normal  0.0351171 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2786  hypothetical protein  23.15 
 
 
217 aa  63.2  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  27.75 
 
 
206 aa  63.2  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  26.97 
 
 
320 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1872  pentapeptide repeat protein  25.29 
 
 
194 aa  63.2  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1144  pentapeptide repeat-containing protein  25.74 
 
 
220 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2262  pentapeptide repeat protein  20.8 
 
 
215 aa  62  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0867  pentapeptide repeat-containing protein  27.82 
 
 
185 aa  62  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3044  pentapeptide repeat protein  26.98 
 
 
253 aa  61.6  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157086  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3729  hypothetical protein  24.48 
 
 
200 aa  61.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.626497  normal  0.855124 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  26.67 
 
 
386 aa  61.2  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0911  pentapeptide repeat protein  25.39 
 
 
215 aa  60.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.545668 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  26.99 
 
 
1191 aa  60.1  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26860  uncharacterized low-complexity protein  24.78 
 
 
220 aa  59.7  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  29.93 
 
 
233 aa  60.1  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1489  pentapeptide repeat protein  30 
 
 
187 aa  60.1  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0526071  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  25.26 
 
 
309 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  27.72 
 
 
360 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  26.77 
 
 
193 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  27.72 
 
 
360 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  27.72 
 
 
360 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  28.89 
 
 
447 aa  58.5  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  27.08 
 
 
190 aa  58.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1483  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  31.36 
 
 
206 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  27.17 
 
 
360 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2126  pentapeptide repeat-containing protein  23.78 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  26.21 
 
 
263 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  27.17 
 
 
360 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2386  hypothetical protein  24.26 
 
 
199 aa  57.4  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.193618 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  27.17 
 
 
360 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  21.89 
 
 
381 aa  56.6  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  26.55 
 
 
312 aa  56.6  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  25.42 
 
 
734 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  22.82 
 
 
739 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  22.82 
 
 
739 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  22.82 
 
 
739 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  26.79 
 
 
242 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  25.43 
 
 
844 aa  55.8  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1432  pentapeptide repeat protein  26.46 
 
 
228 aa  55.8  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.86 
 
 
14916 aa  55.8  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  25.9 
 
 
452 aa  55.8  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  25.95 
 
 
449 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  26.57 
 
 
862 aa  55.5  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0517  hypothetical protein  24.5 
 
 
1048 aa  55.1  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  25.16 
 
 
214 aa  55.5  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  24.68 
 
 
197 aa  55.1  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  26.35 
 
 
343 aa  55.1  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0493  hypothetical protein  24.5 
 
 
1048 aa  55.1  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  26.35 
 
 
343 aa  55.1  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  25.87 
 
 
245 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  29.03 
 
 
191 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  29.86 
 
 
452 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  33.88 
 
 
245 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  22.62 
 
 
401 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0861  pentapeptide repeat-containing protein  27.91 
 
 
354 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0186818  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  23.72 
 
 
607 aa  54.3  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.76 
 
 
525 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2985  pentapeptide repeat protein  26.92 
 
 
222 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  22.62 
 
 
401 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  28.04 
 
 
412 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  28.65 
 
 
349 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  24.83 
 
 
191 aa  53.5  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  22.88 
 
 
225 aa  53.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  30.16 
 
 
485 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  25.64 
 
 
218 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  24.14 
 
 
186 aa  53.1  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3064  pentapeptide repeat protein  26.69 
 
 
224 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  21.43 
 
 
448 aa  52.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  21.63 
 
 
348 aa  52.8  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  25.5 
 
 
222 aa  52.4  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  29.65 
 
 
224 aa  52.4  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0318  pentapeptide repeat-containing protein  29.8 
 
 
452 aa  52.8  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  25.78 
 
 
193 aa  52.4  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  25.13 
 
 
266 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0610  pentapeptide repeat-containing protein  23.87 
 
 
205 aa  52  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  23.7 
 
 
440 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0554  pentapeptide repeat-containing protein  23.49 
 
 
220 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>