More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0198 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 205 aa  412  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  55.17 
 
 		 206 aa  228  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  49.23 
 
 		 197 aa  199  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  51.87 
 
 		 191 aa  191  5e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  48.45 
 
 		 197 aa  186  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  48.68 
 
 		 198 aa  180  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  42.02 
 
 		 193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  38.5 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13397  hypothetical protein  39.31 
 
 		 183 aa  122  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.102743 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  34.44 
 
 		 200 aa  113  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  36.93 
 
 		 183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  35.63 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  35.39 
 
 		 183 aa  104  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  35.39 
 
 		 183 aa  104  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  35.39 
 
 		 183 aa  104  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  34.78 
 
 		 186 aa  101  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  31.79 
 
 		 201 aa  99  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  31.21 
 
 		 201 aa  98.6  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  25.88 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  26.6 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0911  pentapeptide repeat protein  29.06 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545668 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  24.87 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  27.11 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  34.51 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  25.15 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  23.86 
 
 		 567 aa  63.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  27.59 
 
 		 521 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  32.03 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2126  pentapeptide repeat-containing protein  26.13 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  25.17 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  24.86 
 
 		 449 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  21.65 
 
 		 186 aa  62  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3729  hypothetical protein  26.7 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.626497  normal  0.855124 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  28.57 
 
 		 343 aa  61.6  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  28.57 
 
 		 343 aa  61.6  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2059  pentapeptide repeat-containing protein  27.36 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361738  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  24.38 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  24.68 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  24.68 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  26.11 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  24.68 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  27.4 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  24.68 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4064  mcbg protein, putative  26.39 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  24.68 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  22.6 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  30.3 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  26.04 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0867  pentapeptide repeat-containing protein  23.2 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  25.93 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  29.46 
 
 		 862 aa  59.3  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  24.26 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  25.81 
 
 		 381 aa  58.5  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  27.78 
 
 		 232 aa  58.2  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  29.56 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1483  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  24.88 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  26.67 
 
 		 600 aa  57.4  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3404  pentapeptide repeat-containing protein  27.45 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00102719  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  27.27 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  29.81 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  30.95 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  27.44 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  24.3 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3960  pentapeptide repeat-containing protein  27.63 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  29.02 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  27.34 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3445  pentapeptide repeat-containing protein  21.72 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  25.34 
 
 		 180 aa  57  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3302  pentapeptide repeat protein  28.9 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  27.16 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0861  pentapeptide repeat-containing protein  28.19 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0186818  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  22.22 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  28.33 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0506  pentapeptide repeat-containing protein  21.72 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  21.98 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  28.5 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0277  pentapeptide repeat-containing protein  22.56 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  22.99 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  23.85 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  26.44 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  27.04 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  27.33 
 
 		 389 aa  55.5  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3620  pentapeptide repeat-containing protein  21.72 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  26.19 
 
 		 340 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18320  uncharacterized low-complexity protein  30.17 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1144  pentapeptide repeat-containing protein  26.86 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  23.56 
 
 		 976 aa  54.7  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  21.21 
 
 		 191 aa  54.7  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  28.09 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2262  pentapeptide repeat protein  21.94 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  21.72 
 
 		 401 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  27.17 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  21.72 
 
 		 401 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  24.56 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  27.22 
 
 		 363 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  27.27 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  22.53 
 
 		 517 aa  53.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000904  hypothetical protein  22.97 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>