More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2262 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2262  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 215 aa  437  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  32.39 
 
 		 213 aa  99.4  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2126  pentapeptide repeat-containing protein  34.34 
 
 		 200 aa  93.2  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  27.78 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  27.78 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  33.33 
 
 		 211 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1181  pentapeptide repeat protein  24.41 
 
 		 230 aa  92  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.329473 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  28.92 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3729  hypothetical protein  27.72 
 
 		 200 aa  91.3  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.626497  normal  0.855124 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  30 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  30 
 
 		 211 aa  89  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  23.84 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  25.39 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  25.64 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  20 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  21.13 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  20.8 
 
 		 227 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  28.21 
 
 		 214 aa  62  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  22.3 
 
 		 263 aa  61.6  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  22.02 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  27.33 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  23.35 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  20.71 
 
 		 576 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  24.22 
 
 		 739 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  24.22 
 
 		 739 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  24.22 
 
 		 739 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  20.51 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0798  hypothetical protein  25.45 
 
 		 171 aa  60.8  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1872  pentapeptide repeat protein  27.37 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  24.68 
 
 		 447 aa  59.7  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  20.67 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  23.44 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  23.19 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  19.16 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  24.59 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  21.26 
 
 		 567 aa  58.9  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0991  hypothetical protein  35.11 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  25.64 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  22.63 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  21.2 
 
 		 452 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  25.9 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  25.74 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  19.13 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  19.9 
 
 		 286 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  21.43 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  21.43 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  24.86 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  22.17 
 
 		 264 aa  57  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  21.43 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  24.07 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  21.18 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  21.18 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  21.29 
 
 		 401 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  22.7 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0277  pentapeptide repeat-containing protein  25.76 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  28.04 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  18.27 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  25.41 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  26.47 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3692  pentapeptide repeat-containing protein  25.13 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.413415  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  25.3 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  21.29 
 
 		 401 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  21.18 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  21.18 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  23.76 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  20.83 
 
 		 401 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  19.14 
 
 		 456 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  20.83 
 
 		 401 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  21.97 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  23.28 
 
 		 408 aa  55.5  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  21.82 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4774  pentapeptide repeat-containing protein  25.27 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  25.5 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  20.69 
 
 		 360 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  19.76 
 
 		 521 aa  55.1  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  22.7 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  20.3 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  20.69 
 
 		 360 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  18.75 
 
 		 320 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  21.02 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  23.71 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  19.72 
 
 		 449 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  20.45 
 
 		 452 aa  54.3  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  21.72 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  20.36 
 
 		 355 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  21.94 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3757  pentapeptide repeat protein  22.6 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3704  pentapeptide repeat protein  22.6 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 515 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0195  hypothetical protein  20.9 
 
 		 142 aa  53.9  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.673966 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0861  pentapeptide repeat-containing protein  18.75 
 
 		 354 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0186818  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1198  secreted effector protein  31.13 
 
 		 291 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1152  secreted effector protein  31.13 
 
 		 291 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324884  normal  0.527932 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  19.12 
 
 		 351 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  22.34 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  20.95 
 
 		 416 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1185  secreted effector protein  31.13 
 
 		 291 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  20.92 
 
 		 485 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>