More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4864 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
229 aa  466  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  86.9 
 
 
229 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  39.83 
 
 
227 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3302  pentapeptide repeat protein  40.32 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5828  pentapeptide repeat protein  37.25 
 
 
189 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510799  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  24.34 
 
 
227 aa  85.5  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6181  pentapeptide repeat-containing protein  30.33 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.309204  normal  0.0469485 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  30.19 
 
 
193 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  32.21 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  28.99 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  30.67 
 
 
180 aa  71.2  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5595  pentapeptide repeat protein  26.42 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26860  uncharacterized low-complexity protein  26.09 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1144  pentapeptide repeat-containing protein  30 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1295  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  27.78 
 
 
194 aa  68.6  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  26.01 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  26.58 
 
 
190 aa  67.8  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  23.08 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  23.67 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  24.85 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  23.67 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1432  pentapeptide repeat protein  29.9 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35000  uncharacterized low-complexity protein  28.12 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  26.44 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  31.58 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  24.24 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  26.03 
 
 
211 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  23.43 
 
 
225 aa  64.7  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  25.15 
 
 
199 aa  64.3  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2937  hypothetical protein  37.19 
 
 
393 aa  63.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.807989  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  30.3 
 
 
452 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2466  pentapeptide repeat-containing protein  26.25 
 
 
220 aa  62.4  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  28.4 
 
 
449 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2262  pentapeptide repeat protein  22.02 
 
 
215 aa  61.6  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1872  pentapeptide repeat protein  22.41 
 
 
194 aa  61.2  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  24.43 
 
 
193 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1028  pentapeptide repeat-containing protein  27.88 
 
 
180 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.22421  normal  0.0351171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  26.49 
 
 
294 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18320  uncharacterized low-complexity protein  29.19 
 
 
233 aa  60.5  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109994  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1489  pentapeptide repeat protein  27.91 
 
 
187 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0526071  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  23.75 
 
 
340 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  24.06 
 
 
401 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  24.06 
 
 
401 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  20.13 
 
 
381 aa  58.9  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  24.83 
 
 
186 aa  58.5  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.65 
 
 
14916 aa  58.9  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2167  acetyltransferase  24.03 
 
 
308 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  30.26 
 
 
485 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  30 
 
 
261 aa  58.5  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  25.97 
 
 
734 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  22.83 
 
 
401 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  22.83 
 
 
401 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  29.03 
 
 
453 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2786  hypothetical protein  24.07 
 
 
217 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  32.7 
 
 
452 aa  57  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  23.76 
 
 
190 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  26 
 
 
187 aa  57  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1483  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  29.94 
 
 
206 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  31.45 
 
 
844 aa  56.6  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  27.5 
 
 
206 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  28.38 
 
 
358 aa  56.6  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  26.63 
 
 
312 aa  56.2  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  26.77 
 
 
263 aa  56.2  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  22.86 
 
 
309 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  23.78 
 
 
567 aa  56.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  22.29 
 
 
448 aa  56.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3269  pentapeptide repeat-containing protein  26 
 
 
228 aa  56.2  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  24.31 
 
 
233 aa  56.2  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3044  pentapeptide repeat protein  29.84 
 
 
253 aa  56.2  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157086  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  23.86 
 
 
200 aa  55.8  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0318  pentapeptide repeat-containing protein  26.88 
 
 
452 aa  55.5  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  28.57 
 
 
870 aa  55.5  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3064  pentapeptide repeat protein  25.17 
 
 
224 aa  55.5  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2446  acetyltransferase  20 
 
 
308 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.034806  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  27.85 
 
 
242 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2940  pentapeptide repeat protein  25.94 
 
 
201 aa  55.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2247  acetyltransferase  23.26 
 
 
308 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0012519  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  26.09 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2034  pentapeptide repeat-containing protein  29.06 
 
 
354 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895251  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0869  pentapeptide repeat protein  23.87 
 
 
290 aa  53.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.236368  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0543  hypothetical protein  29.06 
 
 
354 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2411  acetyltransferase  23.26 
 
 
308 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  26.4 
 
 
197 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  27.13 
 
 
872 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2132  pentapeptide repeat-containing protein  29.06 
 
 
354 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855918  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1682  hypothetical protein  29.06 
 
 
354 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  23.26 
 
 
262 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  23.26 
 
 
262 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0613  hypothetical protein  29.06 
 
 
354 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205681  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0724  hypothetical protein  29.06 
 
 
354 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3404  pentapeptide repeat-containing protein  22.58 
 
 
192 aa  53.9  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00102719  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2510  acetyltransferase, GNAT family  23.26 
 
 
308 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115896  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  22.34 
 
 
201 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2180  acetyltransferase  23.26 
 
 
308 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000230557  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0277  pentapeptide repeat-containing protein  26.12 
 
 
195 aa  53.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  24.32 
 
 
351 aa  53.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 
264 aa  53.1  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2429  acetyltransferase, gnat family  23.58 
 
 
155 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.287092 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  25.52 
 
 
309 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  23.73 
 
 
182 aa  52.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>