248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0862 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 214 aa  434  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  38.59 
 
 		 197 aa  143  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  37.3 
 
 		 190 aa  139  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  35.91 
 
 		 190 aa  137  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  38.42 
 
 		 193 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  40.99 
 
 		 193 aa  127  9.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  37.89 
 
 		 180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1489  pentapeptide repeat protein  32.97 
 
 		 187 aa  122  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0526071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3404  pentapeptide repeat-containing protein  35.47 
 
 		 192 aa  122  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00102719  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  34.95 
 
 		 193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  36.65 
 
 		 193 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  33.68 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  31.58 
 
 		 191 aa  116  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1483  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  40.97 
 
 		 206 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1295  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  34.78 
 
 		 194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75651  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3782  pentapeptide repeat-containing protein  32.98 
 
 		 220 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0530  pentapeptide repeat-containing protein  32.98 
 
 		 225 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0558  pentapeptide repeat protein  33.51 
 
 		 220 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0554  pentapeptide repeat-containing protein  32.46 
 
 		 220 aa  104  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0610  pentapeptide repeat-containing protein  32.64 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2490  pentapeptide repeat-containing protein  30.53 
 
 		 196 aa  101  9e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  32.76 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0506  pentapeptide repeat-containing protein  31.38 
 
 		 208 aa  99.4  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4064  mcbg protein, putative  31.69 
 
 		 265 aa  98.6  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3445  pentapeptide repeat-containing protein  30.85 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3620  pentapeptide repeat-containing protein  34.32 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0867  pentapeptide repeat-containing protein  30.59 
 
 		 185 aa  96.7  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2591  pentapeptide repeat-containing protein  29.26 
 
 		 204 aa  95.9  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  29.95 
 
 		 199 aa  95.1  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0277  pentapeptide repeat-containing protein  29.76 
 
 		 195 aa  89  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  26.78 
 
 		 186 aa  84.7  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  27.13 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  25.32 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  24.68 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  26.51 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  24.68 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  25.55 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  25.15 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  28.4 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  24.03 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1872  pentapeptide repeat protein  25.26 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  28.17 
 
 		 363 aa  62.4  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  25.36 
 
 		 370 aa  62  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2262  pentapeptide repeat protein  28.21 
 
 		 215 aa  62  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  23.38 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  29.05 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  28.85 
 
 		 976 aa  59.7  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  23.38 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  28.57 
 
 		 880 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 880 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 880 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 880 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  28.97 
 
 		 349 aa  58.2  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 880 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  25.6 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  27.07 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 877 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  27.86 
 
 		 872 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  27.33 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  28.3 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  27.04 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  23.68 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  26.25 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  26.25 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  24.38 
 
 		 949 aa  56.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  26.9 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  26.25 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0861  pentapeptide repeat-containing protein  26.42 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0186818  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  26.45 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1479  pentapeptide repeat protein  25.95 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000330683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  23.16 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  24.06 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3302  pentapeptide repeat protein  24.64 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  26.35 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  25.52 
 
 		 358 aa  55.5  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  25.16 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  24.26 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  25.85 
 
 		 356 aa  55.1  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1348  pentapeptide repeat protein  27.64 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8605  pentapeptide repeat protein  25.77 
 
 		 354 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101304  normal  0.331567 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0869  pentapeptide repeat protein  28.24 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0841759  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0798  hypothetical protein  25.19 
 
 		 171 aa  54.7  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  24.37 
 
 		 846 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  19.57 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  27.81 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  25.93 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000904  hypothetical protein  30.71 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3427  pentapeptide repeat-containing protein  23.53 
 
 		 367 aa  52  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3556  pentapeptide repeat-containing protein  23.53 
 
 		 367 aa  52  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  24.75 
 
 		 200 aa  52  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2132  pentapeptide repeat-containing protein  26.67 
 
 		 354 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855918  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2034  pentapeptide repeat-containing protein  26.67 
 
 		 354 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895251  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2102  hypothetical protein  28.32 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1857  pentapeptide repeat-containing protein  25.35 
 
 		 241 aa  51.6  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899807  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  26.22 
 
 		 355 aa  51.6  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  23.93 
 
 		 447 aa  51.2  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  27.62 
 
 		 825 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  27.62 
 
 		 862 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  27.62 
 
 		 825 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>