More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1064 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 193 aa  386  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  66.84 
 
 		 193 aa  265  2.9999999999999995e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  65.28 
 
 		 193 aa  253  1.0000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  56.48 
 
 		 193 aa  241  5e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  57.74 
 
 		 180 aa  203  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1295  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  52.2 
 
 		 194 aa  192  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75651  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1483  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  43.84 
 
 		 206 aa  166  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  40.96 
 
 		 190 aa  157  7e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  39.78 
 
 		 190 aa  143  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  41.71 
 
 		 191 aa  141  5e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  37.63 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  38.42 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3404  pentapeptide repeat-containing protein  36.98 
 
 		 192 aa  135  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00102719  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1489  pentapeptide repeat protein  36.81 
 
 		 187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0526071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  37.43 
 
 		 187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0867  pentapeptide repeat-containing protein  38.29 
 
 		 185 aa  122  5e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  36.47 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  31.35 
 
 		 199 aa  96.3  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  30 
 
 		 199 aa  92.4  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0277  pentapeptide repeat-containing protein  33.53 
 
 		 195 aa  89.4  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2591  pentapeptide repeat-containing protein  30.36 
 
 		 204 aa  89.4  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2490  pentapeptide repeat-containing protein  29.73 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0610  pentapeptide repeat-containing protein  29.76 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  30.34 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3782  pentapeptide repeat-containing protein  29.48 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0558  pentapeptide repeat protein  29.48 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0530  pentapeptide repeat-containing protein  29.48 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0554  pentapeptide repeat-containing protein  28.9 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3620  pentapeptide repeat-containing protein  29.76 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1872  pentapeptide repeat protein  27.6 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  30.19 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3445  pentapeptide repeat-containing protein  29.17 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0506  pentapeptide repeat-containing protein  29.17 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4064  mcbg protein, putative  27.98 
 
 		 265 aa  72  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  28.96 
 
 		 211 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  29.09 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  31.25 
 
 		 227 aa  72  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  28.96 
 
 		 211 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  28.96 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  28.38 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  29.51 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  29.51 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  28.96 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  26.95 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  29.14 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  29.63 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  26.67 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  26.73 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  25.9 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  25.9 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  25.9 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  23.88 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 227 aa  62  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  27.47 
 
 		 193 aa  62  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  25.91 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  28.49 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  27.44 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  27.07 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  29.51 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0318  pentapeptide repeat-containing protein  27.92 
 
 		 452 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  26 
 
 		 489 aa  59.3  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  26.95 
 
 		 312 aa  58.9  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  24.44 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  25.54 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5595  pentapeptide repeat protein  29.85 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 348 aa  58.2  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  26.47 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  26.62 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  22.22 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  25.84 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1857  pentapeptide repeat-containing protein  27.48 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899807  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  25.17 
 
 		 739 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  25.17 
 
 		 739 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  25.17 
 
 		 739 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  23.28 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3302  pentapeptide repeat protein  25.2 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  28.89 
 
 		 448 aa  54.7  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  22.64 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  25.88 
 
 		 360 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  26.97 
 
 		 355 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  25.81 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  27.01 
 
 		 295 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2102  hypothetical protein  25.95 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  25.88 
 
 		 360 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000904  hypothetical protein  30.71 
 
 		 216 aa  53.9  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  25.88 
 
 		 360 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  25.88 
 
 		 360 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1438  pentapeptide repeat protein  28.68 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0273991  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  27.48 
 
 		 363 aa  53.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  27.74 
 
 		 349 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  27.04 
 
 		 360 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  27.04 
 
 		 360 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  30.7 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0911  pentapeptide repeat protein  27.03 
 
 		 215 aa  53.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545668 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  25.64 
 
 		 949 aa  53.5  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  29.01 
 
 		 176 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  29.01 
 
 		 176 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  26.53 
 
 		 710 aa  53.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  25.17 
 
 		 734 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26570  Pentapeptide repeat protein  26.12 
 
 		 343 aa  53.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>