162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0554 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0554  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 220 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0558  pentapeptide repeat protein  98.64 
 
 		 220 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3782  pentapeptide repeat-containing protein  98.18 
 
 		 220 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0530  pentapeptide repeat-containing protein  95.11 
 
 		 225 aa  427  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0610  pentapeptide repeat-containing protein  83.17 
 
 		 205 aa  343  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4064  mcbg protein, putative  67.79 
 
 		 265 aa  305  3e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3445  pentapeptide repeat-containing protein  70.44 
 
 		 208 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0506  pentapeptide repeat-containing protein  70.44 
 
 		 208 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3620  pentapeptide repeat-containing protein  70.44 
 
 		 208 aa  300  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2490  pentapeptide repeat-containing protein  49.74 
 
 		 196 aa  192  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  46.32 
 
 		 199 aa  181  7e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  44.04 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2591  pentapeptide repeat-containing protein  43.24 
 
 		 204 aa  162  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0277  pentapeptide repeat-containing protein  42.53 
 
 		 195 aa  142  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  32.46 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0867  pentapeptide repeat-containing protein  36.16 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  32.31 
 
 		 191 aa  99  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  31.38 
 
 		 190 aa  92.8  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  32.74 
 
 		 180 aa  91.7  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  29.85 
 
 		 193 aa  88.6  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  30.95 
 
 		 193 aa  88.6  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 197 aa  85.9  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  27.66 
 
 		 190 aa  84.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1872  pentapeptide repeat protein  29.95 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  32.07 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  30.64 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1489  pentapeptide repeat protein  27.42 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0526071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  28.9 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3404  pentapeptide repeat-containing protein  29.73 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00102719  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1295  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  29.52 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75651  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1483  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  31.08 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  25.41 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  25 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  22.6 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  23.16 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  25.93 
 
 		 363 aa  58.5  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  23.16 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  23.16 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  25 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  23.33 
 
 		 846 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  27.01 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  24.32 
 
 		 370 aa  55.8  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  25.43 
 
 		 452 aa  54.7  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  20.9 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  24.24 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  24.02 
 
 		 825 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  24.02 
 
 		 862 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  23.56 
 
 		 358 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  24.02 
 
 		 825 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  24.02 
 
 		 825 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  24.02 
 
 		 825 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  24.02 
 
 		 825 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  24.02 
 
 		 825 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  23.98 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  24.04 
 
 		 949 aa  53.5  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  24.06 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  24.52 
 
 		 452 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  23.49 
 
 		 227 aa  51.6  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  22.95 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0448  pentapeptide repeat-containing protein  22.73 
 
 		 356 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513486  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2084  pentapeptide repeat-containing protein  22.73 
 
 		 356 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  24.32 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0738  pentapeptide repeat-containing protein  22.73 
 
 		 356 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1033  pentapeptide repeat-containing protein  22.73 
 
 		 356 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0799  hypothetical protein  22.73 
 
 		 356 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0711  hypothetical protein  22.73 
 
 		 356 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2007  pentapeptide repeat-containing protein  22.73 
 
 		 356 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  23.73 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2126  pentapeptide repeat-containing protein  23.63 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  24.21 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1891  pentapeptide repeat-containing protein  21.28 
 
 		 356 aa  50.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26570  Pentapeptide repeat protein  23.94 
 
 		 343 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  21.95 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  25.28 
 
 		 886 aa  49.7  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3556  pentapeptide repeat-containing protein  19.41 
 
 		 367 aa  48.9  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  24.64 
 
 		 356 aa  48.9  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  21.71 
 
 		 232 aa  48.9  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3427  pentapeptide repeat-containing protein  19.41 
 
 		 367 aa  48.9  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  25.95 
 
 		 245 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1482  pentapeptide repeat-containing protein  24.16 
 
 		 392 aa  48.5  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0501113  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  23.6 
 
 		 312 aa  48.5  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  23.16 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  24.29 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2141  pentapeptide repeat-containing protein  21.05 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  22.22 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  20.75 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  19.27 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3729  hypothetical protein  23.24 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.626497  normal  0.855124 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  23.62 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  24.63 
 
 		 866 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  20.13 
 
 		 381 aa  46.2  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  23.08 
 
 		 739 aa  46.2  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  23.08 
 
 		 739 aa  46.2  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  23.08 
 
 		 739 aa  46.2  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0861  pentapeptide repeat-containing protein  25.34 
 
 		 354 aa  45.8  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0186818  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2386  hypothetical protein  20.17 
 
 		 199 aa  45.8  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.193618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  23.16 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>