More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0977 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 197 aa  396  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  86.8 
 
 		 197 aa  348  3e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  54.26 
 
 		 206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  52.88 
 
 		 198 aa  187  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  48.45 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  49.46 
 
 		 191 aa  170  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  46.15 
 
 		 193 aa  156  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  40.96 
 
 		 218 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  40.11 
 
 		 183 aa  125  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  38.97 
 
 		 204 aa  123  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  35.56 
 
 		 201 aa  121  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  35.56 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  31.98 
 
 		 200 aa  118  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  38.17 
 
 		 206 aa  117  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  38.25 
 
 		 183 aa  117  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  38.25 
 
 		 183 aa  117  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  38.25 
 
 		 183 aa  117  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  38.89 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13397  hypothetical protein  35.03 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.102743 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  26.7 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  28.49 
 
 		 340 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  28.09 
 
 		 449 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  29.02 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  28.22 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  27.1 
 
 		 567 aa  71.2  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  31.06 
 
 		 521 aa  69.7  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  30.48 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  28.92 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  30.92 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  24.44 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  25.81 
 
 		 903 aa  68.2  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2386  hypothetical protein  31.01 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.193618 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  26.95 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  27.06 
 
 		 309 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  30.1 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  31.21 
 
 		 343 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  31.21 
 
 		 343 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  31.32 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  28.22 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  27.96 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18320  uncharacterized low-complexity protein  30.32 
 
 		 233 aa  64.7  0.0000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  30.69 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  25.65 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  28.4 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  29.55 
 
 		 825 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  31.71 
 
 		 456 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  29.55 
 
 		 825 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  29.55 
 
 		 825 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  29.55 
 
 		 862 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  29.55 
 
 		 825 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  24.29 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  25.47 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  29.55 
 
 		 825 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  29.55 
 
 		 825 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3704  pentapeptide repeat protein  27.27 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3757  pentapeptide repeat protein  27.27 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  25.82 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  28.92 
 
 		 493 aa  62.8  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0798  hypothetical protein  21.43 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  25.41 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  28.21 
 
 		 227 aa  62  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  23.18 
 
 		 182 aa  62  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2102  hypothetical protein  25.24 
 
 		 217 aa  62  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3729  hypothetical protein  25.57 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.626497  normal  0.855124 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  25.71 
 
 		 576 aa  61.6  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4336  pentapeptide repeat-containing protein  28.85 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2635  hypothetical protein  29.82 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.224677  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  30.52 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  26.25 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  22.61 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  26.42 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  30.97 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  23.56 
 
 		 381 aa  59.3  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  31.43 
 
 		 433 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  32.5 
 
 		 862 aa  59.7  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  29.94 
 
 		 420 aa  59.3  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  28.21 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1181  pentapeptide repeat protein  28.76 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.329473 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  28.48 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  25 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  28.74 
 
 		 389 aa  58.5  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  26.85 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  22.11 
 
 		 401 aa  58.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  26.62 
 
 		 384 aa  58.5  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  25.15 
 
 		 336 aa  58.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  25.15 
 
 		 336 aa  58.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  25.69 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  36.26 
 
 		 260 aa  58.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  28.17 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1033  pentapeptide repeat-containing protein  28.95 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2007  pentapeptide repeat-containing protein  28.95 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2084  pentapeptide repeat-containing protein  28.95 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0799  hypothetical protein  28.95 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  28.95 
 
 		 450 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  29.09 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3404  pentapeptide repeat-containing protein  22.86 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00102719  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  26.54 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0711  hypothetical protein  28.95 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0738  pentapeptide repeat-containing protein  28.95 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>