More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6493 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 204 aa  407  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  53.85 
 
 		 206 aa  190  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  46.33 
 
 		 183 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  46.33 
 
 		 183 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  46.33 
 
 		 183 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  48.26 
 
 		 183 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13397  hypothetical protein  48.02 
 
 		 183 aa  153  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.102743 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  49.42 
 
 		 186 aa  153  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  43.1 
 
 		 197 aa  131  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  43.75 
 
 		 218 aa  131  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  38.97 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  36.41 
 
 		 201 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  34.87 
 
 		 201 aa  115  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  37.93 
 
 		 206 aa  114  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  37.77 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  35.63 
 
 		 205 aa  106  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  37.23 
 
 		 191 aa  105  7e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  37.62 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  28.74 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  31.34 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  29.17 
 
 		 521 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  27.62 
 
 		 381 aa  76.3  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  26.84 
 
 		 401 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  26.84 
 
 		 401 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  33.72 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  34.86 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  42.59 
 
 		 1033 aa  73.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  26.29 
 
 		 448 aa  73.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  31.98 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  31.98 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  31.98 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  28.8 
 
 		 401 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  28.8 
 
 		 401 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  34.53 
 
 		 370 aa  72  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  34.66 
 
 		 493 aa  72.4  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  29.71 
 
 		 567 aa  71.6  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  28.1 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.91 
 
 		 14916 aa  70.9  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  33.95 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  31.4 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  32.41 
 
 		 489 aa  70.5  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  31.29 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  33.13 
 
 		 449 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  41.82 
 
 		 517 aa  70.1  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18320  uncharacterized low-complexity protein  34.44 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2330  pentapeptide repeat protein  29.94 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229245 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  35.06 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  31.4 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  39.52 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  32.68 
 
 		 493 aa  69.7  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  31.4 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  27.22 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  30.06 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3704  pentapeptide repeat protein  30.57 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3757  pentapeptide repeat protein  30.57 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  28.57 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  29.48 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  28.57 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  32.3 
 
 		 453 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  32.72 
 
 		 452 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  34.69 
 
 		 286 aa  68.2  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  29.47 
 
 		 242 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  29.19 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  30.32 
 
 		 340 aa  67.8  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  29.47 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  32.3 
 
 		 485 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  27.27 
 
 		 452 aa  67.4  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  27.11 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  31.61 
 
 		 250 aa  67  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  31.01 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  31.36 
 
 		 825 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  31.36 
 
 		 825 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  28.25 
 
 		 386 aa  66.2  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  31.36 
 
 		 862 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  31.36 
 
 		 825 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  31.36 
 
 		 825 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3289  pentapeptide repeat containing protein  28.74 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.051928  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  31.36 
 
 		 825 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3552  pentapeptide repeat-containing protein  32.97 
 
 		 415 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  28.5 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  31.36 
 
 		 825 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  30 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  33.09 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2376  pentapeptide repeat-containing protein  41.38 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0340424 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27891  hypothetical protein  43.27 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  33.12 
 
 		 416 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  27.38 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  26.67 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  32.08 
 
 		 456 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  27.53 
 
 		 333 aa  65.1  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  24.39 
 
 		 844 aa  65.1  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  32.04 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  34.31 
 
 		 343 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  34.31 
 
 		 343 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  26.49 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  32.19 
 
 		 1191 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  31.17 
 
 		 363 aa  64.7  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  29.63 
 
 		 332 aa  64.7  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>