More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0360 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 191 aa  379  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  56.32 
 
 		 198 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  55.08 
 
 		 206 aa  194  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  51.87 
 
 		 205 aa  191  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  48.91 
 
 		 197 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  49.46 
 
 		 197 aa  170  9e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  44.74 
 
 		 193 aa  145  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  35.83 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  32.78 
 
 		 200 aa  112  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  37.23 
 
 		 218 aa  112  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  35 
 
 		 201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  37.23 
 
 		 204 aa  105  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  37.7 
 
 		 206 aa  101  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13397  hypothetical protein  37.14 
 
 		 183 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.102743 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  34.66 
 
 		 186 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  34.48 
 
 		 183 aa  97.8  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  34.46 
 
 		 183 aa  94.7  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  34.46 
 
 		 183 aa  94.7  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  34.46 
 
 		 183 aa  94.7  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  28.86 
 
 		 218 aa  87.8  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  27.67 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  31.52 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  26.21 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0911  pentapeptide repeat protein  26.73 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545668 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  27.96 
 
 		 449 aa  75.1  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  27.08 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  26.25 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  26.09 
 
 		 517 aa  73.2  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2102  hypothetical protein  26.7 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3692  pentapeptide repeat-containing protein  29.95 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.413415  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  29.81 
 
 		 309 aa  72  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  27.18 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  25.68 
 
 		 567 aa  70.9  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2059  pentapeptide repeat-containing protein  24.76 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  29.05 
 
 		 576 aa  70.1  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  25.37 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  28.87 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  24.73 
 
 		 340 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  29.61 
 
 		 266 aa  68.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2034  pentapeptide repeat-containing protein  32.57 
 
 		 354 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895251  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2132  pentapeptide repeat-containing protein  32.57 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855918  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  25.79 
 
 		 320 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  28.87 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  29.72 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1181  pentapeptide repeat protein  28.49 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.329473 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3729  hypothetical protein  23.37 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.626497  normal  0.855124 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  29.56 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  29.94 
 
 		 300 aa  65.1  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  31.14 
 
 		 250 aa  65.1  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  26.95 
 
 		 336 aa  64.7  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  26.95 
 
 		 336 aa  64.7  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  27.35 
 
 		 245 aa  64.3  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  26.19 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  26.63 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18320  uncharacterized low-complexity protein  32.61 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  34.29 
 
 		 452 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  28.76 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3269  pentapeptide repeat-containing protein  28.98 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  25.88 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  28.14 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  29.94 
 
 		 521 aa  62.4  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  28.31 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3404  pentapeptide repeat-containing protein  26.74 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00102719  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 493 aa  62  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  23.24 
 
 		 227 aa  62  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  25.31 
 
 		 446 aa  62  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  26.53 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  25.28 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  32.53 
 
 		 456 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  28.57 
 
 		 309 aa  61.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1682  hypothetical protein  31.18 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  25.56 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  23.66 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0543  hypothetical protein  31.18 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2142  pentapeptide repeat-containing protein  28.06 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0724  hypothetical protein  31.18 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  20.11 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  28.34 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  26.88 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3064  pentapeptide repeat protein  27.51 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  24.59 
 
 		 949 aa  60.8  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1438  pentapeptide repeat protein  24.05 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0273991  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0613  hypothetical protein  31.18 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205681  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  28.48 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  29.69 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  25 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  30.72 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  27.87 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  32 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  25.5 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000904  hypothetical protein  24.39 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  25.15 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  26.22 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  28.82 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  24.08 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  24.08 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  26.38 
 
 		 311 aa  58.9  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  29.14 
 
 		 278 aa  58.5  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  30.13 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  26.97 
 
 		 600 aa  58.5  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>