More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2556 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 197 aa  402  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  48.68 
 
 		 190 aa  192  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  40.96 
 
 		 190 aa  156  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  38.59 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  37.63 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1483  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  35.64 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1489  pentapeptide repeat protein  40.85 
 
 		 187 aa  137  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0526071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  37.1 
 
 		 193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  35.87 
 
 		 193 aa  134  6.0000000000000005e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3404  pentapeptide repeat-containing protein  37.31 
 
 		 192 aa  132  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00102719  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  37.28 
 
 		 180 aa  131  7.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  35.48 
 
 		 193 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1295  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  36.07 
 
 		 194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75651  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  32.28 
 
 		 191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  35.96 
 
 		 187 aa  115  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  31.25 
 
 		 186 aa  108  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0867  pentapeptide repeat-containing protein  34.32 
 
 		 185 aa  104  9e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0277  pentapeptide repeat-containing protein  31.76 
 
 		 195 aa  91.3  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2591  pentapeptide repeat-containing protein  30.3 
 
 		 204 aa  88.2  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0558  pentapeptide repeat protein  33.87 
 
 		 220 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0530  pentapeptide repeat-containing protein  33.87 
 
 		 225 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3782  pentapeptide repeat-containing protein  33.87 
 
 		 220 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  25.93 
 
 		 199 aa  87  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4064  mcbg protein, putative  33.7 
 
 		 265 aa  86.7  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0610  pentapeptide repeat-containing protein  31.47 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0554  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 220 aa  85.9  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3445  pentapeptide repeat-containing protein  29.59 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  30.37 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1872  pentapeptide repeat protein  29.79 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3620  pentapeptide repeat-containing protein  30.81 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0506  pentapeptide repeat-containing protein  29.59 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2490  pentapeptide repeat-containing protein  29.79 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  28.96 
 
 		 183 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  28.1 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  28.02 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  27.5 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  27.5 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  27.5 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  24.44 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  25.6 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  29.65 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  29.01 
 
 		 739 aa  67  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  28.89 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  29.01 
 
 		 739 aa  67  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  29.01 
 
 		 739 aa  67  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  24.43 
 
 		 844 aa  65.5  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  26.19 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  25.81 
 
 		 976 aa  64.3  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  26.49 
 
 		 456 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  24.46 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  24.48 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  27.01 
 
 		 227 aa  62  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  24.67 
 
 		 348 aa  62  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  26.34 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  26.11 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0517  hypothetical protein  25 
 
 		 1048 aa  60.5  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0493  hypothetical protein  25 
 
 		 1048 aa  60.5  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  23.89 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0911  pentapeptide repeat protein  27.41 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545668 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  27.65 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13397  hypothetical protein  28.39 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.102743 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2102  hypothetical protein  30.25 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  27.42 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  26.49 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  24.82 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  27.67 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  23.63 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1482  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 392 aa  58.9  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0501113  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  25.29 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  26.25 
 
 		 866 aa  58.9  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  27.71 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  23.74 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  23.56 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  26.77 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  28.03 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  20.49 
 
 		 381 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  22.49 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  28.12 
 
 		 846 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  23.44 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  27.84 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  25.81 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  27.13 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  22.29 
 
 		 312 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  28.03 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  25.49 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2635  hypothetical protein  24.55 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.224677  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  26.7 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  27.84 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  22.35 
 
 		 448 aa  56.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  25.16 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  27.12 
 
 		 360 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  23.78 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  25.14 
 
 		 360 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  27.12 
 
 		 360 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3134  pentapeptide repeat protein  27.34 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  27.12 
 
 		 360 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  27.12 
 
 		 360 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2786  hypothetical protein  22.88 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  21.43 
 
 		 449 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>