257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3601 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 199 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2490  pentapeptide repeat-containing protein  46.84 
 
 		 196 aa  181  7e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4064  mcbg protein, putative  46.63 
 
 		 265 aa  176  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3620  pentapeptide repeat-containing protein  44.1 
 
 		 208 aa  174  8e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0530  pentapeptide repeat-containing protein  44.56 
 
 		 225 aa  171  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3782  pentapeptide repeat-containing protein  44.56 
 
 		 220 aa  171  5e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3445  pentapeptide repeat-containing protein  43.59 
 
 		 208 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0558  pentapeptide repeat protein  47.43 
 
 		 220 aa  171  9e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0554  pentapeptide repeat-containing protein  44.04 
 
 		 220 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0610  pentapeptide repeat-containing protein  44.56 
 
 		 205 aa  169  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  44.1 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0506  pentapeptide repeat-containing protein  42.56 
 
 		 208 aa  168  6e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2591  pentapeptide repeat-containing protein  42.63 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0277  pentapeptide repeat-containing protein  37.31 
 
 		 195 aa  136  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  36.81 
 
 		 180 aa  105  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  30.85 
 
 		 191 aa  104  8e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  29.17 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  30.53 
 
 		 190 aa  96.7  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  29.95 
 
 		 214 aa  95.1  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  33.93 
 
 		 193 aa  94.4  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  30 
 
 		 193 aa  92.4  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0867  pentapeptide repeat-containing protein  31.79 
 
 		 185 aa  91.3  9e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 193 aa  89  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1489  pentapeptide repeat protein  30.72 
 
 		 187 aa  88.2  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0526071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1295  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  32.09 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75651  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  25.93 
 
 		 197 aa  87  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  26.73 
 
 		 197 aa  85.1  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  32 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  26.7 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  29.32 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  29.17 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  29.23 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3404  pentapeptide repeat-containing protein  30.68 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00102719  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1872  pentapeptide repeat protein  26.67 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  25.26 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  26.6 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  25.65 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  28.71 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  26.98 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  24.3 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  26.67 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  27.75 
 
 		 242 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  25.48 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  26.39 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  27.38 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  27.71 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  27.71 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  25.48 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  27.59 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  18.18 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  27.59 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  27.59 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  27.53 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1483  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  27.38 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  27.03 
 
 		 360 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  27.03 
 
 		 360 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  27.03 
 
 		 360 aa  62  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  29.45 
 
 		 370 aa  62  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  26.53 
 
 		 191 aa  62  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  24.52 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  25.62 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  27.04 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  25.26 
 
 		 949 aa  60.1  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  26.96 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3960  pentapeptide repeat-containing protein  26.83 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0911  pentapeptide repeat protein  23.76 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545668 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  24.48 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  31.21 
 
 		 872 aa  57.8  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  24.68 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  25.15 
 
 		 343 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  25.15 
 
 		 343 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  25.58 
 
 		 348 aa  57  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  25.32 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  24.46 
 
 		 449 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2262  pentapeptide repeat protein  25.3 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  30.99 
 
 		 349 aa  55.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  27.78 
 
 		 358 aa  55.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  28.33 
 
 		 452 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  24.64 
 
 		 825 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  24.64 
 
 		 825 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  24.64 
 
 		 825 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  24.64 
 
 		 825 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  24.64 
 
 		 825 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  24.64 
 
 		 862 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  24.28 
 
 		 320 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0798  hypothetical protein  26.47 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  24.64 
 
 		 825 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  28.96 
 
 		 485 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  24.88 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1891  pentapeptide repeat-containing protein  21.89 
 
 		 356 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  22.61 
 
 		 881 aa  54.7  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  25.43 
 
 		 452 aa  54.7  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  24.06 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  23.46 
 
 		 976 aa  53.9  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  25 
 
 		 846 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  25.62 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  23.3 
 
 		 844 aa  53.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  29.22 
 
 		 453 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  23.84 
 
 		 355 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>