More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3960 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_3960  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 229 aa  455  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  65.22 
 
 		 232 aa  291  5e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  60.73 
 
 		 224 aa  239  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  48.87 
 
 		 242 aa  186  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  49.09 
 
 		 242 aa  186  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  42.5 
 
 		 233 aa  149  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  38.61 
 
 		 243 aa  122  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  31.84 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  31.43 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  31.25 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18320  uncharacterized low-complexity protein  33.33 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  31.72 
 
 		 517 aa  83.2  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  35.75 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  35.75 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  35.75 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  34.21 
 
 		 449 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  32.78 
 
 		 567 aa  82  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  33.71 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  29.57 
 
 		 401 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  29.03 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  32.41 
 
 		 483 aa  77  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  32.02 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  29.83 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  29.83 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  28.64 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  31.49 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  30.28 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  31.03 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  29.41 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  30.29 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  30.39 
 
 		 493 aa  73.2  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  34.17 
 
 		 452 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  30.29 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  33.51 
 
 		 250 aa  72  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  30.45 
 
 		 389 aa  72  0.000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  29.51 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  29.67 
 
 		 336 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  32.5 
 
 		 485 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  31.21 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  29.67 
 
 		 336 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  31.71 
 
 		 453 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5310  pentapeptide repeat protein  34.31 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923126  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  34 
 
 		 456 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  29.15 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  28.43 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  32.16 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  30.73 
 
 		 862 aa  69.3  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  30.8 
 
 		 521 aa  68.6  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  27.5 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.63 
 
 		 525 aa  68.6  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  28.57 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  29.41 
 
 		 1191 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  24.1 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  29.27 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  29.89 
 
 		 183 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  24.1 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  31.16 
 
 		 877 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0724  hypothetical protein  28.44 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  31.52 
 
 		 182 aa  67  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  30.77 
 
 		 880 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1682  hypothetical protein  28.44 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  29.78 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  31.16 
 
 		 880 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0861  pentapeptide repeat-containing protein  30.8 
 
 		 354 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0186818  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  28 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  27.65 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  27.95 
 
 		 319 aa  67  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  30.77 
 
 		 880 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  24.1 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  30.77 
 
 		 880 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0613  hypothetical protein  28.44 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205681  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  31.98 
 
 		 295 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  24.56 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  31.4 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  26.04 
 
 		 734 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4879  pentapeptide repeat-containing protein  25.99 
 
 		 657 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.511853 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  30.73 
 
 		 576 aa  66.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  31.19 
 
 		 880 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0543  hypothetical protein  28.44 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2034  pentapeptide repeat-containing protein  28.44 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895251  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  28.14 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  31.25 
 
 		 332 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  24.56 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  33.16 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2132  pentapeptide repeat-containing protein  28.44 
 
 		 354 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  30.51 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  30.11 
 
 		 343 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  30.11 
 
 		 343 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  24.56 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  30.37 
 
 		 881 aa  65.5  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  28.33 
 
 		 440 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5006  pentapeptide repeat-containing protein  32.08 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  29.07 
 
 		 366 aa  65.1  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  29.07 
 
 		 366 aa  65.1  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  27.5 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  28.57 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  25.11 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  30.85 
 
 		 870 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0707  pentapeptide repeat protein  26.55 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>