More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_18320 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_18320  uncharacterized low-complexity protein  100 
 
 
233 aa  447  1e-125  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109994  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  35.24 
 
 
243 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  35.34 
 
 
224 aa  99.4  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  32.84 
 
 
232 aa  90.5  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3960  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
229 aa  83.6  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  33.47 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  32.56 
 
 
242 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  31.49 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  36.82 
 
 
433 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  30.05 
 
 
567 aa  80.9  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  37.37 
 
 
449 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  31.53 
 
 
862 aa  79.7  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  33.17 
 
 
254 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  34.41 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  30.86 
 
 
447 aa  75.9  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  30.33 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  33.16 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  31.32 
 
 
312 aa  75.9  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  35.9 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  33.85 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  32.64 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  35.56 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  29.28 
 
 
370 aa  73.2  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  32.94 
 
 
446 aa  73.2  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  30.14 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  32.29 
 
 
333 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  31.55 
 
 
340 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  32.85 
 
 
745 aa  71.6  0.000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  33.15 
 
 
521 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  33.14 
 
 
489 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  30.97 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  30.97 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  30.73 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  31.03 
 
 
576 aa  70.5  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  32.6 
 
 
268 aa  70.5  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  36.69 
 
 
416 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  34.57 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  32.76 
 
 
363 aa  70.1  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  34.97 
 
 
1033 aa  70.1  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1482  pentapeptide repeat-containing protein  34.39 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0501113  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  34.44 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  28.83 
 
 
381 aa  69.7  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  35.63 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  34.65 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0440  pentapeptide repeat-containing protein  25.79 
 
 
601 aa  68.9  0.00000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  31.89 
 
 
515 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  35.67 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  32.97 
 
 
517 aa  68.9  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  28.44 
 
 
727 aa  68.6  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  30.57 
 
 
493 aa  68.6  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  34.19 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0995  pentapeptide repeat protein  34.62 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0411427 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  35.85 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  30.35 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  30.99 
 
 
351 aa  68.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  30.2 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  31.58 
 
 
401 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  33.77 
 
 
225 aa  67  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  37.36 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  30.89 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  31.58 
 
 
401 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  31.98 
 
 
343 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  30.89 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  31.98 
 
 
343 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  33.74 
 
 
389 aa  67.4  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  32.32 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  30.69 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  32.52 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  34.24 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  37.98 
 
 
903 aa  65.5  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  30.52 
 
 
266 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  34.78 
 
 
456 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  32.42 
 
 
332 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  31.25 
 
 
420 aa  65.5  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  27.92 
 
 
450 aa  65.5  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  30.32 
 
 
197 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  33.53 
 
 
776 aa  64.3  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  34.33 
 
 
245 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  32.91 
 
 
259 aa  64.7  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  27.86 
 
 
262 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  34.43 
 
 
452 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  33.96 
 
 
199 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  30.69 
 
 
1191 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  37.82 
 
 
973 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  33 
 
 
299 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  31.28 
 
 
386 aa  63.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5310  pentapeptide repeat protein  36.09 
 
 
264 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923126  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  29.65 
 
 
706 aa  63.9  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  29.23 
 
 
262 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  30.32 
 
 
197 aa  64.3  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  33.13 
 
 
263 aa  63.5  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  29.67 
 
 
189 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  35.44 
 
 
447 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  31.93 
 
 
184 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  32.61 
 
 
191 aa  63.2  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  29.61 
 
 
355 aa  62.8  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  26.92 
 
 
401 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  34.64 
 
 
204 aa  62.8  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0433008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>