More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0995 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0995  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 260 aa  501  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0411427 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5006  pentapeptide repeat-containing protein  53.54 
 
 		 267 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5310  pentapeptide repeat protein  54.59 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923126  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4774  pentapeptide repeat-containing protein  45.87 
 
 		 266 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  36.44 
 
 		 449 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  33.2 
 
 		 286 aa  94.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  38.46 
 
 		 213 aa  92.8  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  42.68 
 
 		 1033 aa  92.4  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  33.94 
 
 		 309 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  29.46 
 
 		 381 aa  90.5  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  36.41 
 
 		 254 aa  89.7  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  35.75 
 
 		 389 aa  89.7  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  39.55 
 
 		 214 aa  89.7  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  31.7 
 
 		 489 aa  88.6  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  36.87 
 
 		 567 aa  88.2  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  34.02 
 
 		 234 aa  86.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  36.28 
 
 		 517 aa  86.7  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  36.89 
 
 		 485 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  38.12 
 
 		 215 aa  85.1  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  33.51 
 
 		 600 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  34.17 
 
 		 576 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  35.06 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  32.43 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  37.89 
 
 		 745 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  36.36 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  29.58 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  36.93 
 
 		 332 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  29.55 
 
 		 340 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  29.11 
 
 		 401 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  34.88 
 
 		 320 aa  82.4  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  36.41 
 
 		 453 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  31.49 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  34.65 
 
 		 268 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  31.49 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  33.92 
 
 		 456 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  29.96 
 
 		 521 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  34.33 
 
 		 493 aa  81.3  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  34.25 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  33.04 
 
 		 433 aa  79.7  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  29.82 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  37.08 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  36.04 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  34.72 
 
 		 452 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  30.22 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  35.98 
 
 		 870 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  32.2 
 
 		 219 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  32.13 
 
 		 483 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  36.13 
 
 		 493 aa  78.2  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  30.73 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  30.73 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  31.82 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2500  pentapeptide repeat-containing protein  36.13 
 
 		 433 aa  77  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  37.11 
 
 		 184 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  34.11 
 
 		 515 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.97 
 
 		 14916 aa  77  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0477  pentapeptide repeat protein  32.71 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  34.59 
 
 		 416 aa  75.9  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  34.57 
 
 		 727 aa  75.9  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  35.43 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  29.67 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  29.67 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  36.64 
 
 		 180 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  37.25 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  34.55 
 
 		 776 aa  75.1  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  23.58 
 
 		 607 aa  75.1  0.000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  35.42 
 
 		 204 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  31.49 
 
 		 862 aa  75.1  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  31.28 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  35.26 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0707  pentapeptide repeat protein  31.03 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  35.14 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  31.72 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  31.94 
 
 		 734 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  36.08 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  30.52 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  31.72 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  30.36 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  34.43 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  33.48 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  33.51 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  34.07 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  35.27 
 
 		 1191 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  32.67 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  34.78 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1585  pentapeptide repeat-containing protein  32.24 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000106738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  30.1 
 
 		 448 aa  72.8  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  32.31 
 
 		 419 aa  72.4  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  29.41 
 
 		 262 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  32.69 
 
 		 285 aa  72  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  31.68 
 
 		 438 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 199 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  32.65 
 
 		 872 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  34.88 
 
 		 174 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  34.39 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  29.78 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0577  hypothetical protein  26.53 
 
 		 961 aa  70.9  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  34.13 
 
 		 441 aa  70.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  39.49 
 
 		 165 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>