More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1540 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 183 aa  364  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  87.71 
 
 		 186 aa  314  4e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  74.59 
 
 		 183 aa  277  6e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  74.59 
 
 		 183 aa  277  6e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  74.59 
 
 		 183 aa  277  6e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13397  hypothetical protein  67.23 
 
 		 183 aa  239  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.102743 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  50.28 
 
 		 206 aa  161  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  48.26 
 
 		 204 aa  155  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  42.37 
 
 		 197 aa  137  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  40.11 
 
 		 197 aa  125  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  39.88 
 
 		 201 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  41.46 
 
 		 218 aa  117  7.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  39.29 
 
 		 201 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  36.93 
 
 		 205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  32.93 
 
 		 200 aa  105  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  35.33 
 
 		 206 aa  104  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  36.47 
 
 		 193 aa  102  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  34.48 
 
 		 191 aa  97.8  7e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  34.86 
 
 		 198 aa  94.7  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  31.55 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  27.93 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  30.32 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  27.81 
 
 		 190 aa  72  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  31.9 
 
 		 242 aa  72  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  28.25 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  28.96 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  28.25 
 
 		 211 aa  70.9  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  28.25 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  30.26 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  28 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  30.05 
 
 		 493 aa  69.3  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  31.17 
 
 		 521 aa  68.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  29.45 
 
 		 903 aa  68.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  27.37 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  30 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3960  pentapeptide repeat-containing protein  29.89 
 
 		 229 aa  67.8  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  30.9 
 
 		 232 aa  67  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  30.18 
 
 		 449 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  30.54 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  27.68 
 
 		 211 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  26.09 
 
 		 440 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  27.12 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  26.74 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  30.41 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  26.63 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  27.5 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3692  pentapeptide repeat-containing protein  28.09 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.413415  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  30.63 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  33.58 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  31.21 
 
 		 277 aa  64.3  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  27.47 
 
 		 844 aa  64.3  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  28.24 
 
 		 193 aa  64.3  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  26.67 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  28.07 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  28.57 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  26.32 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  27.39 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3729  hypothetical protein  26.2 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.626497  normal  0.855124 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  30.41 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  28.66 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4774  pentapeptide repeat-containing protein  28.65 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  30.23 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0798  hypothetical protein  23.35 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  29.75 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  32.68 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  27.38 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  23.03 
 
 		 448 aa  62  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  29.51 
 
 		 203 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  27.71 
 
 		 180 aa  62  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  28.26 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  28.4 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2386  hypothetical protein  28.02 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.193618 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  29.07 
 
 		 343 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  28.26 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  29.07 
 
 		 343 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  29.8 
 
 		 515 aa  61.6  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  28.4 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  28.29 
 
 		 264 aa  61.2  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  24.86 
 
 		 348 aa  61.2  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1483  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  32.14 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  27.88 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  25.71 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  32.12 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  25.6 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  34.27 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1181  pentapeptide repeat protein  28.81 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.329473 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  28.1 
 
 		 600 aa  60.1  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0867  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  29.48 
 
 		 517 aa  59.7  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  29.38 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  31.62 
 
 		 408 aa  59.7  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  28.8 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  29.47 
 
 		 389 aa  59.7  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  29.23 
 
 		 576 aa  59.3  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  25.66 
 
 		 386 aa  59.3  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  26.32 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  31.29 
 
 		 862 aa  59.3  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  26.32 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  32.93 
 
 		 420 aa  58.9  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>