More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3671 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 218 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  87.16 
 
 		 218 aa  394  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  69.27 
 
 		 218 aa  320  8e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2102  hypothetical protein  64.93 
 
 		 217 aa  292  3e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  60.93 
 
 		 216 aa  288  5.0000000000000004e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000904  hypothetical protein  60 
 
 		 216 aa  280  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  55.05 
 
 		 218 aa  260  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3692  pentapeptide repeat-containing protein  55.96 
 
 		 218 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.413415  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  53.17 
 
 		 223 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2059  pentapeptide repeat-containing protein  43.54 
 
 		 214 aa  181  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0911  pentapeptide repeat protein  41.27 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545668 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  30.35 
 
 		 245 aa  99  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  28.11 
 
 		 261 aa  91.7  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  28.7 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  26.44 
 
 		 381 aa  82.4  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  26.21 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  28.11 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  28.19 
 
 		 449 aa  79  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  26.09 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  27.4 
 
 		 600 aa  78.6  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  25.75 
 
 		 452 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  28.06 
 
 		 485 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  33.13 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  28.7 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  29.76 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  23.08 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  25.59 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  27.46 
 
 		 521 aa  72  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  29.59 
 
 		 204 aa  72  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  26.97 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  24.74 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  29.59 
 
 		 355 aa  70.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  25.49 
 
 		 517 aa  70.1  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  30.9 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  30.9 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  26.47 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  27.41 
 
 		 453 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  28.19 
 
 		 401 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  28.19 
 
 		 401 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  29.38 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  29.76 
 
 		 576 aa  69.3  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  25.23 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  26.48 
 
 		 320 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  28.43 
 
 		 489 aa  68.9  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  28.02 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  25.87 
 
 		 456 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  26.89 
 
 		 389 aa  68.6  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  23.81 
 
 		 448 aa  68.6  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  27.4 
 
 		 976 aa  68.2  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  26.4 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  31.1 
 
 		 1033 aa  67  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  27.05 
 
 		 567 aa  67  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  28.9 
 
 		 300 aa  67  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  22.94 
 
 		 336 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  26.72 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  27.96 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  29.86 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  22.94 
 
 		 336 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  26.88 
 
 		 493 aa  66.6  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  25.25 
 
 		 862 aa  66.2  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  31.39 
 
 		 446 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  26.9 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  24.02 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  25 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  26.09 
 
 		 340 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  27.38 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  26.73 
 
 		 268 aa  65.1  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  26.32 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  26.32 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  26.32 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0995  pentapeptide repeat protein  30.69 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0411427 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  25.63 
 
 		 493 aa  64.3  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  32.35 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0440  pentapeptide repeat-containing protein  27.72 
 
 		 601 aa  63.5  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2330  pentapeptide repeat protein  27.4 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229245 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  25.21 
 
 		 880 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  27.01 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  24.05 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  25.21 
 
 		 880 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  25.21 
 
 		 880 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  26.83 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  25.21 
 
 		 880 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  24.06 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  29.75 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1482  pentapeptide repeat-containing protein  25.62 
 
 		 392 aa  62.8  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0501113  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  29.75 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  26.89 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  26.29 
 
 		 872 aa  62.8  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  30.07 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  25.21 
 
 		 877 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  25.21 
 
 		 880 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  25.33 
 
 		 825 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  25.33 
 
 		 825 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  25.33 
 
 		 825 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  25.33 
 
 		 862 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4774  pentapeptide repeat-containing protein  27.19 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  25.27 
 
 		 401 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  25.33 
 
 		 825 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  30.36 
 
 		 870 aa  62.4  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>