More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01855 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  100 
 
 
191 aa  387  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  44.31 
 
 
193 aa  158  4e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  45.14 
 
 
193 aa  157  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  43.71 
 
 
193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  41.92 
 
 
180 aa  142  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  41.71 
 
 
193 aa  141  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1295  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  38.14 
 
 
194 aa  141  6e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75651  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  38.33 
 
 
187 aa  136  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  40.68 
 
 
186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1483  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  33.98 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1489  pentapeptide repeat protein  34.62 
 
 
187 aa  124  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0526071  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  37.58 
 
 
190 aa  123  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  31.05 
 
 
190 aa  120  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  32.28 
 
 
197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  31.58 
 
 
214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  34.85 
 
 
199 aa  115  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3404  pentapeptide repeat-containing protein  32.98 
 
 
192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00102719  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4064  mcbg protein, putative  35.09 
 
 
265 aa  108  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0867  pentapeptide repeat-containing protein  32.43 
 
 
185 aa  107  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3620  pentapeptide repeat-containing protein  33.92 
 
 
208 aa  105  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3445  pentapeptide repeat-containing protein  33.92 
 
 
208 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2591  pentapeptide repeat-containing protein  35.88 
 
 
204 aa  105  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  30.85 
 
 
199 aa  104  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0506  pentapeptide repeat-containing protein  33.92 
 
 
208 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3782  pentapeptide repeat-containing protein  32.82 
 
 
220 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0530  pentapeptide repeat-containing protein  32.82 
 
 
225 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2490  pentapeptide repeat-containing protein  35.09 
 
 
196 aa  99.8  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0558  pentapeptide repeat protein  33.92 
 
 
220 aa  99.4  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0554  pentapeptide repeat-containing protein  32.31 
 
 
220 aa  99  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0610  pentapeptide repeat-containing protein  33.15 
 
 
205 aa  98.2  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0277  pentapeptide repeat-containing protein  32.18 
 
 
195 aa  95.5  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  33.59 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  29.85 
 
 
229 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  28.99 
 
 
229 aa  71.6  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1872  pentapeptide repeat protein  25.79 
 
 
194 aa  71.2  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  22.42 
 
 
227 aa  68.6  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  27.38 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  20.73 
 
 
198 aa  63.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  30.23 
 
 
211 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  30.23 
 
 
211 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  23.16 
 
 
363 aa  63.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  26.25 
 
 
320 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  24.68 
 
 
449 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  28.91 
 
 
215 aa  62.4  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  25.85 
 
 
242 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  22.36 
 
 
218 aa  62.4  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  29.92 
 
 
211 aa  62  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  25.49 
 
 
844 aa  62  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  25.32 
 
 
183 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  25.32 
 
 
183 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  25.32 
 
 
183 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  30.3 
 
 
401 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  30.3 
 
 
401 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  28.26 
 
 
211 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0448  pentapeptide repeat-containing protein  20.13 
 
 
356 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513486  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0799  hypothetical protein  20.13 
 
 
356 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2084  pentapeptide repeat-containing protein  20.13 
 
 
356 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1891  pentapeptide repeat-containing protein  19.88 
 
 
356 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2007  pentapeptide repeat-containing protein  20.13 
 
 
356 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0711  hypothetical protein  20.13 
 
 
356 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3302  pentapeptide repeat protein  25.93 
 
 
225 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0738  pentapeptide repeat-containing protein  20.13 
 
 
356 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1033  pentapeptide repeat-containing protein  20.13 
 
 
356 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  26.03 
 
 
242 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2500  pentapeptide repeat-containing protein  25.44 
 
 
433 aa  60.5  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  29.92 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  28.08 
 
 
200 aa  59.3  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  26.09 
 
 
381 aa  59.7  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  25.84 
 
 
216 aa  59.7  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  29.92 
 
 
211 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  26.28 
 
 
360 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  26.35 
 
 
286 aa  58.5  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  26.28 
 
 
360 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  26.28 
 
 
360 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  27.61 
 
 
225 aa  58.2  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  23.53 
 
 
739 aa  58.2  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  23.53 
 
 
739 aa  58.2  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  23.53 
 
 
739 aa  58.2  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  24.32 
 
 
201 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  25.49 
 
 
245 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  26.28 
 
 
309 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  24.38 
 
 
485 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2836  pentapeptide repeat protein  30.57 
 
 
368 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  24.82 
 
 
355 aa  57.4  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  25.57 
 
 
360 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  25.64 
 
 
360 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  26.07 
 
 
218 aa  57  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2102  hypothetical protein  27.78 
 
 
217 aa  56.6  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  27.38 
 
 
349 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  30 
 
 
450 aa  57  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  29.3 
 
 
201 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2985  pentapeptide repeat protein  24.18 
 
 
222 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  29.17 
 
 
216 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  27.46 
 
 
234 aa  56.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  26.01 
 
 
360 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  23.49 
 
 
262 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  24.85 
 
 
227 aa  55.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  24.5 
 
 
267 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  23.49 
 
 
262 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  27.78 
 
 
261 aa  55.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.440819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>