More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1685 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 186 aa  379  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  44.89 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  40.68 
 
 		 191 aa  132  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  38.51 
 
 		 190 aa  132  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  37.87 
 
 		 180 aa  123  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  38.79 
 
 		 193 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  39.39 
 
 		 193 aa  117  7e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  36.32 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  35.76 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1295  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  33.9 
 
 		 194 aa  111  5e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75651  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  36.47 
 
 		 193 aa  110  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  31.25 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1489  pentapeptide repeat protein  32.93 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0526071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0867  pentapeptide repeat-containing protein  27.91 
 
 		 185 aa  85.1  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3404  pentapeptide repeat-containing protein  28.02 
 
 		 192 aa  85.5  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00102719  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1483  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  32.87 
 
 		 206 aa  85.1  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  26.78 
 
 		 214 aa  84.7  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  30.72 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  32 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2490  pentapeptide repeat-containing protein  29.7 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2591  pentapeptide repeat-containing protein  28.74 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  33.08 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  28.38 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  33.6 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  33.6 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  33.6 
 
 		 211 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0610  pentapeptide repeat-containing protein  26.67 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  33.86 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  30.28 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  32.8 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3445  pentapeptide repeat-containing protein  26.82 
 
 		 208 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0506  pentapeptide repeat-containing protein  26.82 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4064  mcbg protein, putative  26.52 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3620  pentapeptide repeat-containing protein  26.86 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3782  pentapeptide repeat-containing protein  25.95 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0530  pentapeptide repeat-containing protein  25.95 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  24.24 
 
 		 360 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  24.85 
 
 		 360 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  34.43 
 
 		 576 aa  64.3  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0558  pentapeptide repeat protein  26.23 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  24.47 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  26.21 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  25.45 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0554  pentapeptide repeat-containing protein  25.41 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  24.24 
 
 		 360 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  24.24 
 
 		 360 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  29.52 
 
 		 846 aa  62.8  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  24.24 
 
 		 360 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18320  uncharacterized low-complexity protein  26.21 
 
 		 233 aa  62  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0277  pentapeptide repeat-containing protein  27.75 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  21.65 
 
 		 205 aa  62  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  28.14 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  29.45 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  28.99 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  26.39 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  25 
 
 		 449 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  25.73 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  26.62 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  30.16 
 
 		 401 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  30.16 
 
 		 401 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  24.83 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  28.77 
 
 		 386 aa  58.5  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2059  pentapeptide repeat-containing protein  29.45 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  27.27 
 
 		 844 aa  58.2  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  26.19 
 
 		 381 aa  58.2  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  25.97 
 
 		 870 aa  58.2  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  30.86 
 
 		 349 aa  57.8  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  27.34 
 
 		 233 aa  57.8  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  23.57 
 
 		 416 aa  57.8  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  25.69 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0911  pentapeptide repeat protein  26.7 
 
 		 215 aa  57  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545668 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  28.46 
 
 		 227 aa  57  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  26.8 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  30.66 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0798  hypothetical protein  27.33 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1181  pentapeptide repeat protein  28 
 
 		 230 aa  57  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.329473 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3134  pentapeptide repeat protein  26.32 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  29.66 
 
 		 521 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3960  pentapeptide repeat-containing protein  26.39 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  29.5 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  27.92 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2102  hypothetical protein  25.67 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  29.93 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  28.31 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  26.96 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  25.81 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  29.08 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  26.14 
 
 		 433 aa  55.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  27.81 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  28.12 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  26.9 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  26.14 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  26.21 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  23.95 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2985  pentapeptide repeat protein  26.32 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  26.16 
 
 		 872 aa  55.1  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  26.47 
 
 		 485 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  25.28 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  28.06 
 
 		 348 aa  55.1  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  26.25 
 
 		 452 aa  54.3  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>