More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1207 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
213 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  35.38 
 
 
211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  34.91 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  34.43 
 
 
211 aa  112  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  34.91 
 
 
211 aa  111  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  34.91 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  33.96 
 
 
211 aa  109  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2262  pentapeptide repeat protein  30.66 
 
 
215 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1181  pentapeptide repeat protein  27.49 
 
 
230 aa  101  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.329473 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2126  pentapeptide repeat-containing protein  31.47 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  24.86 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3729  hypothetical protein  30.43 
 
 
200 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.626497  normal  0.855124 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  33.59 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0798  hypothetical protein  32.72 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  24.73 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  29.41 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  33.97 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  26.88 
 
 
381 aa  71.6  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0992  hypothetical protein  40.87 
 
 
119 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  21.69 
 
 
227 aa  71.6  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  34.01 
 
 
190 aa  70.9  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  30.28 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  21.76 
 
 
229 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  19.68 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  22.93 
 
 
206 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  34.4 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  29.89 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  29.05 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  30.17 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  22.99 
 
 
193 aa  68.9  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  30.2 
 
 
180 aa  67.8  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  26.7 
 
 
201 aa  67  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3302  pentapeptide repeat protein  25.33 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0867  pentapeptide repeat-containing protein  29.32 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2102  hypothetical protein  26.98 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  26.46 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  29.14 
 
 
193 aa  65.5  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2490  pentapeptide repeat-containing protein  27.22 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  20.35 
 
 
218 aa  65.1  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0577  hypothetical protein  27.5 
 
 
961 aa  64.3  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  26.03 
 
 
225 aa  64.3  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  23.39 
 
 
234 aa  64.3  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 
521 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  27.4 
 
 
242 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  23.24 
 
 
206 aa  64.7  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  23 
 
 
739 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0977  pentapeptide repeat protein  41.43 
 
 
108 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0814566 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  23 
 
 
739 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  23 
 
 
739 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  22.93 
 
 
197 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  25.53 
 
 
493 aa  63.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0950  pentapeptide repeat protein  41.43 
 
 
108 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  22.7 
 
 
204 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  19.07 
 
 
309 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  22.87 
 
 
250 aa  63.5  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  23.33 
 
 
198 aa  62.8  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  25.9 
 
 
199 aa  62.8  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0558  pentapeptide repeat protein  25.58 
 
 
220 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  24.31 
 
 
183 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  24.31 
 
 
183 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  23.81 
 
 
223 aa  62  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  24.31 
 
 
183 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  27.97 
 
 
976 aa  62  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  24.4 
 
 
567 aa  62  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0530  pentapeptide repeat-containing protein  25.58 
 
 
225 aa  61.6  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  20.49 
 
 
273 aa  61.6  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3782  pentapeptide repeat-containing protein  25.58 
 
 
220 aa  61.6  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0554  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 
220 aa  61.6  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  24.02 
 
 
201 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  26.71 
 
 
242 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4336  pentapeptide repeat-containing protein  25.21 
 
 
187 aa  61.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789922  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  25.49 
 
 
291 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  25.49 
 
 
291 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  29.52 
 
 
218 aa  60.1  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6181  pentapeptide repeat-containing protein  22.45 
 
 
201 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.309204  normal  0.0469485 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0610  pentapeptide repeat-containing protein  25.7 
 
 
205 aa  59.7  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  20.21 
 
 
485 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  25.12 
 
 
218 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  22.82 
 
 
278 aa  58.9  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  22.82 
 
 
263 aa  58.9  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  22.09 
 
 
214 aa  58.9  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  19.6 
 
 
243 aa  58.9  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  22.94 
 
 
359 aa  58.2  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  25.99 
 
 
320 aa  58.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  21.99 
 
 
349 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  23.04 
 
 
204 aa  57.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  25.35 
 
 
358 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  26.62 
 
 
363 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3960  pentapeptide repeat-containing protein  22.02 
 
 
229 aa  57.4  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0415  hypothetical protein  22.94 
 
 
325 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0277  pentapeptide repeat-containing protein  23.37 
 
 
195 aa  57  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  21.94 
 
 
312 aa  56.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  26.21 
 
 
319 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  24.68 
 
 
446 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  22.8 
 
 
199 aa  57  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  20.45 
 
 
727 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  20.5 
 
 
213 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  28.81 
 
 
250 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  23.7 
 
 
191 aa  56.2  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>