More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1590 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  100 
 
 		 218 aa  449  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  69.27 
 
 		 218 aa  320  8e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  67.89 
 
 		 218 aa  317  9e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2102  hypothetical protein  68.08 
 
 		 217 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  58.8 
 
 		 216 aa  280  9e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000904  hypothetical protein  58.33 
 
 		 216 aa  275  5e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  55.96 
 
 		 218 aa  272  3e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3692  pentapeptide repeat-containing protein  56.42 
 
 		 218 aa  249  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.413415  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  52.94 
 
 		 223 aa  227  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2059  pentapeptide repeat-containing protein  44.85 
 
 		 214 aa  179  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0911  pentapeptide repeat protein  41.88 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  30.04 
 
 		 261 aa  88.6  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  28 
 
 		 245 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  25.65 
 
 		 381 aa  87  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  29.47 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  27.98 
 
 		 449 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  26.29 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  26.94 
 
 		 332 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  30.95 
 
 		 576 aa  75.5  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  25.91 
 
 		 489 aa  75.1  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  26.84 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  26.36 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  27.18 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  25.63 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  26.06 
 
 		 521 aa  70.5  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  32.69 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  29.47 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  24.75 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  27.37 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  25 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  25.12 
 
 		 448 aa  68.2  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  27.38 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  27.38 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  24.1 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  25 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  25.6 
 
 		 493 aa  66.6  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  24 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  22.82 
 
 		 336 aa  65.1  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  22.82 
 
 		 336 aa  65.1  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  25.82 
 
 		 880 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  23.98 
 
 		 300 aa  65.1  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  25.82 
 
 		 880 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  25.82 
 
 		 880 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  26.01 
 
 		 607 aa  64.7  0.000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  22.92 
 
 		 567 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  24.76 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  23.74 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  27.38 
 
 		 452 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  25.41 
 
 		 877 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  25.41 
 
 		 880 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  25.41 
 
 		 880 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  26.89 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  25.62 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2330  pentapeptide repeat protein  24.64 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229245 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  25.4 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  23.15 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  27.4 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  29.01 
 
 		 233 aa  62  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  23.83 
 
 		 386 aa  62  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  25.13 
 
 		 493 aa  62  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  24.6 
 
 		 264 aa  61.6  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  27.23 
 
 		 710 aa  61.6  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  26.67 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  22.44 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  26.47 
 
 		 453 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  24.14 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  24.88 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  22.87 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  30.25 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  28 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  25.36 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  25.25 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0995  pentapeptide repeat protein  28.65 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0411427 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  23.7 
 
 		 433 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  27.06 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  24.64 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  23.33 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1482  pentapeptide repeat-containing protein  26.67 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0501113  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  25.37 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  23.74 
 
 		 949 aa  60.5  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  31.25 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  29.52 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  26.75 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  24.65 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  24.65 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  24.47 
 
 		 441 aa  59.3  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  23.22 
 
 		 600 aa  59.7  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  27.67 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  26.7 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  26.9 
 
 		 485 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  26.41 
 
 		 872 aa  59.3  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  31.2 
 
 		 452 aa  58.9  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  23.53 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  24.88 
 
 		 401 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  24.89 
 
 		 517 aa  58.9  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  22.75 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  24.4 
 
 		 456 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  24.59 
 
 		 976 aa  58.9  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  25.13 
 
 		 412 aa  58.5  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>