More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1161 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 180 aa  364  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  71.26 
 
 		 193 aa  245  3e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  67.66 
 
 		 193 aa  238  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  58.93 
 
 		 193 aa  209  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  57.74 
 
 		 193 aa  203  8e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1295  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  56.29 
 
 		 194 aa  197  9e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75651  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1483  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  43.72 
 
 		 206 aa  151  5e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  41.92 
 
 		 191 aa  142  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  37.08 
 
 		 190 aa  139  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  41.82 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  41.67 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  37.28 
 
 		 197 aa  131  6e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1489  pentapeptide repeat protein  39.39 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0526071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  37.89 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0867  pentapeptide repeat-containing protein  39.41 
 
 		 185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  37.87 
 
 		 186 aa  123  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3404  pentapeptide repeat-containing protein  38.85 
 
 		 192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00102719  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  36.81 
 
 		 199 aa  105  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2490  pentapeptide repeat-containing protein  35.12 
 
 		 196 aa  104  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3620  pentapeptide repeat-containing protein  35.8 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0277  pentapeptide repeat-containing protein  36.02 
 
 		 195 aa  101  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  33.9 
 
 		 199 aa  99.4  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0506  pentapeptide repeat-containing protein  34.66 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3445  pentapeptide repeat-containing protein  34.66 
 
 		 208 aa  98.6  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4064  mcbg protein, putative  33.33 
 
 		 265 aa  94.7  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0610  pentapeptide repeat-containing protein  31.98 
 
 		 205 aa  94.7  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0554  pentapeptide repeat-containing protein  32.74 
 
 		 220 aa  91.7  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0530  pentapeptide repeat-containing protein  32.14 
 
 		 225 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0558  pentapeptide repeat protein  30.65 
 
 		 220 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2591  pentapeptide repeat-containing protein  29.83 
 
 		 204 aa  90.5  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3782  pentapeptide repeat-containing protein  32.14 
 
 		 220 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1872  pentapeptide repeat protein  29.83 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  33.1 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  33.1 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  33.1 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  30.67 
 
 		 229 aa  71.2  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  32.39 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  31.54 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  30.2 
 
 		 213 aa  67.8  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  32.39 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  31.69 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  29.23 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  27.11 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  27.44 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  26.83 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  26.83 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  26.83 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  27.71 
 
 		 183 aa  62  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  27.69 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  34 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.17 
 
 		 525 aa  60.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  26.83 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3692  pentapeptide repeat-containing protein  27.27 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.413415  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1533  pentapeptide repeat-containing protein  31.36 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  25.64 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  27.55 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  28.3 
 
 		 261 aa  57  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  28.67 
 
 		 242 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  24.7 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  24.14 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  27.27 
 
 		 825 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1636  Ion transport 2 domain protein  27.97 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2034  pentapeptide repeat-containing protein  29.63 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895251  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0543  hypothetical protein  29.63 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0724  hypothetical protein  29.63 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1682  hypothetical protein  29.63 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  28.76 
 
 		 456 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  30.53 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  31.91 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2132  pentapeptide repeat-containing protein  29.63 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855918  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0613  hypothetical protein  29.63 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205681  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  25.34 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0798  hypothetical protein  23.98 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000904  hypothetical protein  30.72 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0911  pentapeptide repeat protein  27.75 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545668 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  29.93 
 
 		 355 aa  55.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3130  pentapeptide repeat-containing protein  30.51 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352835 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  26.57 
 
 		 825 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  26.57 
 
 		 825 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  26.57 
 
 		 825 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  26.57 
 
 		 862 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  26.57 
 
 		 825 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  26.57 
 
 		 825 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  27.95 
 
 		 348 aa  55.5  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  27.22 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  26.09 
 
 		 360 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  26.09 
 
 		 360 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  31.21 
 
 		 349 aa  55.1  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  27.81 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  26.09 
 
 		 360 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  30.49 
 
 		 976 aa  54.7  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  25.56 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  30.41 
 
 		 517 aa  54.7  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  28.15 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  27.22 
 
 		 356 aa  54.7  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2059  pentapeptide repeat-containing protein  30.46 
 
 		 214 aa  54.3  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  32.76 
 
 		 567 aa  54.3  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  29.37 
 
 		 218 aa  54.3  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>