135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0277 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0277  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 195 aa  402  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2490  pentapeptide repeat-containing protein  47.49 
 
 		 196 aa  159  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  44.97 
 
 		 199 aa  154  9e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0610  pentapeptide repeat-containing protein  43.43 
 
 		 205 aa  149  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4064  mcbg protein, putative  43.02 
 
 		 265 aa  148  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3620  pentapeptide repeat-containing protein  41.9 
 
 		 208 aa  143  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3782  pentapeptide repeat-containing protein  43.1 
 
 		 220 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0530  pentapeptide repeat-containing protein  40.51 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0558  pentapeptide repeat protein  43.1 
 
 		 220 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3445  pentapeptide repeat-containing protein  41.9 
 
 		 208 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0554  pentapeptide repeat-containing protein  42.53 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0506  pentapeptide repeat-containing protein  41.9 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2591  pentapeptide repeat-containing protein  38.86 
 
 		 204 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  37.31 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  36.02 
 
 		 180 aa  101  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  38.37 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  32.18 
 
 		 191 aa  95.5  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 193 aa  93.6  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  31.76 
 
 		 197 aa  91.3  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1489  pentapeptide repeat protein  31.18 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0526071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  33.53 
 
 		 193 aa  89.4  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  29.76 
 
 		 214 aa  89  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 193 aa  88.6  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0867  pentapeptide repeat-containing protein  31.32 
 
 		 185 aa  87  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1295  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  31.67 
 
 		 194 aa  85.9  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75651  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  30.34 
 
 		 187 aa  85.9  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  30.23 
 
 		 190 aa  85.5  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  27.96 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1483  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  32.65 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3404  pentapeptide repeat-containing protein  31.87 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00102719  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  29.17 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  27.53 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0798  hypothetical protein  24.4 
 
 		 171 aa  64.3  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  28.57 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  28.57 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1872  pentapeptide repeat protein  24.62 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  27.68 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  27.75 
 
 		 186 aa  62  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  27.68 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5595  pentapeptide repeat protein  28.24 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  28.05 
 
 		 872 aa  58.5  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  26.55 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  23.37 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  23.08 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2262  pentapeptide repeat protein  25.76 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  22.56 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  28.1 
 
 		 949 aa  55.5  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  25.27 
 
 		 976 aa  55.5  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  24.63 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  25.45 
 
 		 453 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  26.12 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  25.45 
 
 		 452 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  25.84 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  26.37 
 
 		 844 aa  52.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  25.15 
 
 		 485 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  21.97 
 
 		 197 aa  52  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  23.5 
 
 		 261 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  22.28 
 
 		 355 aa  49.3  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 250 aa  48.9  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  21.91 
 
 		 363 aa  49.3  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  27.15 
 
 		 356 aa  49.3  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  24.44 
 
 		 243 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  23.4 
 
 		 359 aa  48.1  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3302  pentapeptide repeat protein  22.58 
 
 		 225 aa  48.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  26.63 
 
 		 349 aa  48.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3729  hypothetical protein  24.87 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.626497  normal  0.855124 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  25.17 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  22.4 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2409  pentapeptide repeat-containing protein  33.98 
 
 		 123 aa  46.6  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  23.08 
 
 		 245 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  25.81 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  25.18 
 
 		 862 aa  46.6  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  25.81 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  25.81 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  26.51 
 
 		 370 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  25.69 
 
 		 456 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  24.83 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  26.24 
 
 		 356 aa  46.2  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  18.93 
 
 		 348 aa  45.8  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13397  hypothetical protein  21.76 
 
 		 183 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.102743 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  23.75 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  22.54 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  20.62 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2126  pentapeptide repeat-containing protein  22.93 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  35.29 
 
 		 1901 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2678  pentapeptide repeat-containing protein  26.89 
 
 		 168 aa  45.1  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6425  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 167 aa  45.1  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.878148 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  21.52 
 
 		 215 aa  45.1  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  22.56 
 
 		 825 aa  45.1  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  26.44 
 
 		 846 aa  45.1  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  22.56 
 
 		 825 aa  45.1  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  22.56 
 
 		 825 aa  45.1  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  22.56 
 
 		 825 aa  45.1  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  22.56 
 
 		 825 aa  45.1  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  23.68 
 
 		 227 aa  45.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  25.73 
 
 		 360 aa  44.7  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  22.56 
 
 		 862 aa  44.7  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  25.73 
 
 		 360 aa  44.7  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  25.73 
 
 		 360 aa  44.7  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  22.56 
 
 		 825 aa  44.7  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>