More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13397 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13397  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  363  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.102743 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  65.03 
 
 		 183 aa  240  9e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  65.03 
 
 		 183 aa  240  9e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  65.03 
 
 		 183 aa  240  9e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  67.23 
 
 		 183 aa  239  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  65.17 
 
 		 186 aa  224  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  51.96 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  48.02 
 
 		 204 aa  153  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  45.56 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  39.31 
 
 		 205 aa  122  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  37.22 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  36.93 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  30.68 
 
 		 200 aa  101  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  35.03 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  37.14 
 
 		 191 aa  99.4  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  37.87 
 
 		 193 aa  99  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  36.97 
 
 		 206 aa  97.8  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  36.26 
 
 		 198 aa  94.7  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  31.37 
 
 		 381 aa  71.2  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3289  pentapeptide repeat containing protein  29.17 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.051928  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  28.21 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  32 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  28.72 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  29.49 
 
 		 903 aa  65.9  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  29.45 
 
 		 184 aa  64.3  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  24.39 
 
 		 359 aa  64.3  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  31.12 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  27.91 
 
 		 567 aa  64.3  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  31.01 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  27.33 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  31.01 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  28.72 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  32.88 
 
 		 180 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  32.28 
 
 		 263 aa  62  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  28.29 
 
 		 174 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4774  pentapeptide repeat-containing protein  32.22 
 
 		 266 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  25 
 
 		 333 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  29.75 
 
 		 489 aa  60.8  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3556  pentapeptide repeat-containing protein  26.99 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3427  pentapeptide repeat-containing protein  26.99 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0445  hypothetical protein  31.61 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.242099 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  26.95 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  29.09 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  22.91 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  22.91 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  29.07 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  22.91 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  27.06 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  27.85 
 
 		 600 aa  59.7  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  28.39 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  28.02 
 
 		 449 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  27.78 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  30.38 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  28.26 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  26.43 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  27.66 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  30.3 
 
 		 420 aa  58.9  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  30.63 
 
 		 493 aa  58.9  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  28.75 
 
 		 776 aa  58.5  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  26.24 
 
 		 401 aa  58.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  26.24 
 
 		 401 aa  58.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  28.05 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  24.85 
 
 		 300 aa  58.2  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  25.43 
 
 		 218 aa  57  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2635  hypothetical protein  30.92 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.224677  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  30.69 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  29.17 
 
 		 273 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  23.91 
 
 		 211 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  29.28 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  32.12 
 
 		 184 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  26.16 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  37.66 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  28.16 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  25.35 
 
 		 267 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  24.38 
 
 		 448 aa  56.6  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  24.16 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  28.18 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  30.12 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  23.7 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  31.58 
 
 		 412 aa  55.5  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  27.75 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1882  hypothetical protein  32.91 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  29.17 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  29.11 
 
 		 483 aa  55.1  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3302  pentapeptide repeat protein  29.38 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0449  pentapeptide repeat protein  22.75 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00280297  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  28.29 
 
 		 336 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  23.37 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  28.29 
 
 		 336 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  26.67 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  28.05 
 
 		 294 aa  54.7  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  28.31 
 
 		 576 aa  54.7  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  30.89 
 
 		 261 aa  54.7  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  45.71 
 
 		 412 aa  54.7  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4336  pentapeptide repeat-containing protein  25.32 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  30.97 
 
 		 234 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  29.1 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  30.88 
 
 		 419 aa  54.7  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  25.17 
 
 		 446 aa  54.7  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>