More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5595 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5595  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 221 aa  444  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26860  uncharacterized low-complexity protein  33.78 
 
 		 220 aa  115  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35000  uncharacterized low-complexity protein  34.71 
 
 		 216 aa  105  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3044  pentapeptide repeat protein  41.57 
 
 		 253 aa  102  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3064  pentapeptide repeat protein  35.94 
 
 		 224 aa  98.6  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2786  hypothetical protein  32.42 
 
 		 217 aa  92.4  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  28.89 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3269  pentapeptide repeat-containing protein  33.53 
 
 		 228 aa  85.9  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3302  pentapeptide repeat protein  32.5 
 
 		 225 aa  85.5  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2386  hypothetical protein  26.53 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.193618 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6181  pentapeptide repeat-containing protein  30.56 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.309204  normal  0.0469485 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  26.03 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1432  pentapeptide repeat protein  31.25 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  22.49 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  22.49 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  26.42 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  22.01 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2466  pentapeptide repeat-containing protein  29.41 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  23.44 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  22.97 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  22.97 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  25.47 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  30.99 
 
 		 452 aa  62  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2940  pentapeptide repeat protein  27.06 
 
 		 201 aa  62  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  29.92 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  30.06 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  27.27 
 
 		 452 aa  60.1  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  25.57 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  25.57 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2034  pentapeptide repeat-containing protein  30.72 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895251  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  26.01 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0277  pentapeptide repeat-containing protein  28.24 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  28.49 
 
 		 456 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18320  uncharacterized low-complexity protein  30.11 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2132  pentapeptide repeat-containing protein  30.72 
 
 		 354 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855918  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1144  pentapeptide repeat-containing protein  27.57 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  29.85 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  26.88 
 
 		 449 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  24.16 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0745  pentapeptide repeat protein  26.85 
 
 		 971 aa  57.8  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.888113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0318  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  26.88 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  28.66 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  25.29 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1181  pentapeptide repeat protein  29.2 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.329473 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4879  pentapeptide repeat-containing protein  30.41 
 
 		 657 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.511853 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  24.74 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  29.79 
 
 		 485 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 446 aa  55.5  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  25.95 
 
 		 381 aa  55.5  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  30.41 
 
 		 358 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2126  pentapeptide repeat-containing protein  22.17 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  29.79 
 
 		 453 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  26.26 
 
 		 349 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  22.96 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  22.92 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  36.44 
 
 		 493 aa  54.3  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  29.03 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 825 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  29.29 
 
 		 360 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  28.57 
 
 		 309 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 825 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3556  pentapeptide repeat-containing protein  26.77 
 
 		 367 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3427  pentapeptide repeat-containing protein  26.77 
 
 		 367 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  27.69 
 
 		 734 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 825 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 825 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3729  hypothetical protein  20.77 
 
 		 200 aa  53.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.626497  normal  0.855124 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  29.29 
 
 		 360 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  32.82 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  32.41 
 
 		 277 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  26.78 
 
 		 886 aa  53.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  24.86 
 
 		 286 aa  52.8  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  29.29 
 
 		 360 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  30.81 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 862 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  28.99 
 
 		 846 aa  52.4  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  32.41 
 
 		 332 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1728  pentapeptide repeat-containing protein  31.25 
 
 		 389 aa  52.4  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.952308  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  19.3 
 
 		 213 aa  52  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  27.56 
 
 		 180 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  30.71 
 
 		 343 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  26.7 
 
 		 336 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  30.71 
 
 		 343 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  26.7 
 
 		 336 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  28.79 
 
 		 360 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  31.67 
 
 		 268 aa  52  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1872  pentapeptide repeat protein  21.81 
 
 		 194 aa  52  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  28.79 
 
 		 360 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  27.01 
 
 		 862 aa  52  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  29.73 
 
 		 361 aa  52  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  28.79 
 
 		 360 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  22.22 
 
 		 607 aa  51.6  0.000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  27.66 
 
 		 191 aa  51.6  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  26.92 
 
 		 706 aa  51.6  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5828  pentapeptide repeat protein  32.14 
 
 		 189 aa  51.6  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510799  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2409  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 123 aa  51.2  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0867  pentapeptide repeat-containing protein  22.6 
 
 		 185 aa  51.6  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  26.63 
 
 		 412 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  24 
 
 		 359 aa  51.2  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>