83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2940 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2940  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
201 aa  379  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35000  uncharacterized low-complexity protein  41.15 
 
 
216 aa  148  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3044  pentapeptide repeat protein  46.02 
 
 
253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157086  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26860  uncharacterized low-complexity protein  37.06 
 
 
220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2386  hypothetical protein  34.5 
 
 
199 aa  104  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.193618 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3064  pentapeptide repeat protein  35.19 
 
 
224 aa  97.8  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2786  hypothetical protein  33.33 
 
 
217 aa  93.2  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3269  pentapeptide repeat-containing protein  30.6 
 
 
228 aa  86.7  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5595  pentapeptide repeat protein  29.71 
 
 
221 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  25.94 
 
 
229 aa  58.5  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  24.47 
 
 
356 aa  55.8  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  26.42 
 
 
229 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3302  pentapeptide repeat protein  27.32 
 
 
225 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  26.97 
 
 
449 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  24.71 
 
 
245 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  24.38 
 
 
200 aa  50.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0867  pentapeptide repeat-containing protein  21.64 
 
 
185 aa  50.1  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  29.79 
 
 
191 aa  49.3  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  21.15 
 
 
218 aa  49.3  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  29.17 
 
 
881 aa  48.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  23.49 
 
 
381 aa  48.1  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  26.59 
 
 
213 aa  48.1  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  21.67 
 
 
401 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1682  hypothetical protein  28.93 
 
 
354 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0724  hypothetical protein  28.93 
 
 
354 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0613  hypothetical protein  28.93 
 
 
354 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205681  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6181  pentapeptide repeat-containing protein  28.48 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.309204  normal  0.0469485 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0543  hypothetical protein  29.88 
 
 
354 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  25 
 
 
227 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2126  pentapeptide repeat-containing protein  20.79 
 
 
200 aa  46.6  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2034  pentapeptide repeat-containing protein  28.93 
 
 
354 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895251  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  26.9 
 
 
215 aa  47  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0861  pentapeptide repeat-containing protein  29.07 
 
 
354 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0186818  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  25.45 
 
 
567 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  25.48 
 
 
343 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  25.48 
 
 
343 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  19.35 
 
 
218 aa  46.2  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  22.15 
 
 
401 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2132  pentapeptide repeat-containing protein  28.3 
 
 
354 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855918  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  25.91 
 
 
205 aa  45.4  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  25.93 
 
 
197 aa  45.4  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3960  pentapeptide repeat-containing protein  27.51 
 
 
229 aa  45.4  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  25.14 
 
 
233 aa  45.1  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1483  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  27.92 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  26.14 
 
 
332 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6425  pentapeptide repeat-containing protein  24.49 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.878148 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2985  pentapeptide repeat protein  22.49 
 
 
222 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  26.59 
 
 
214 aa  43.5  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  23.78 
 
 
336 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  23.78 
 
 
336 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  24.57 
 
 
234 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  21.97 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4336  pentapeptide repeat-containing protein  24.66 
 
 
187 aa  43.5  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789922  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  19.41 
 
 
190 aa  43.5  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  26.06 
 
 
1191 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  23.08 
 
 
483 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  27.54 
 
 
234 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.1 
 
 
14916 aa  42.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  23.46 
 
 
401 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  27.54 
 
 
234 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  17.35 
 
 
227 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  23.46 
 
 
401 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3134  pentapeptide repeat protein  24.58 
 
 
222 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  25.19 
 
 
355 aa  42.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  23.49 
 
 
350 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  22.95 
 
 
320 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 
189 aa  42  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  29.34 
 
 
218 aa  42  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  30.72 
 
 
412 aa  41.6  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  24.05 
 
 
844 aa  41.6  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  28.32 
 
 
243 aa  41.6  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  24.34 
 
 
420 aa  41.6  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  20.38 
 
 
949 aa  41.6  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  27.86 
 
 
493 aa  41.6  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1408  hypothetical protein  23.47 
 
 
167 aa  41.2  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6421  hypothetical protein  23.47 
 
 
167 aa  41.2  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  22.82 
 
 
348 aa  41.6  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  23.84 
 
 
213 aa  41.6  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1432  pentapeptide repeat protein  27.18 
 
 
228 aa  41.2  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3552  pentapeptide repeat-containing protein  26.6 
 
 
415 aa  41.2  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  21.38 
 
 
199 aa  41.2  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  24.49 
 
 
242 aa  41.2  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  26.88 
 
 
186 aa  41.2  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>