241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3044 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3044  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 253 aa  478  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2940  pentapeptide repeat protein  44.23 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35000  uncharacterized low-complexity protein  39.89 
 
 		 216 aa  132  6.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26860  uncharacterized low-complexity protein  37.62 
 
 		 220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3064  pentapeptide repeat protein  36.42 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5595  pentapeptide repeat protein  38.12 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2786  hypothetical protein  35.48 
 
 		 217 aa  98.6  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3269  pentapeptide repeat-containing protein  35.06 
 
 		 228 aa  98.6  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2386  hypothetical protein  30.36 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.193618 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3302  pentapeptide repeat protein  31.35 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  27.11 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  27.63 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1432  pentapeptide repeat protein  33.52 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  32.85 
 
 		 452 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3960  pentapeptide repeat-containing protein  31.61 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  28.81 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  30.15 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  30.23 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  28.66 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  32.11 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  34.39 
 
 		 453 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  28.91 
 
 		 485 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  21.67 
 
 		 211 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  32.56 
 
 		 1033 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  29.86 
 
 		 332 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  22.62 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  31.53 
 
 		 411 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  25.95 
 
 		 600 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  22.62 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  30.06 
 
 		 449 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2262  pentapeptide repeat protein  20.93 
 
 		 215 aa  53.9  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  27.78 
 
 		 233 aa  53.1  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  30.36 
 
 		 877 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  26.17 
 
 		 440 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  27.46 
 
 		 320 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  33.13 
 
 		 184 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3074  putative signal transduction protein with Nacht domain  34.83 
 
 		 851 aa  52.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.39797e-24 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6181  pentapeptide repeat-containing protein  27.35 
 
 		 201 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.309204  normal  0.0469485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.51 
 
 		 14916 aa  52.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  29.46 
 
 		 567 aa  52  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  30.81 
 
 		 870 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  34.69 
 
 		 180 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  29.89 
 
 		 191 aa  51.6  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  28.57 
 
 		 343 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  28.57 
 
 		 343 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  24.51 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  27.45 
 
 		 340 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  28.71 
 
 		 218 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  30.36 
 
 		 880 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  30.36 
 
 		 880 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  30.36 
 
 		 880 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  30.36 
 
 		 880 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  25.9 
 
 		 401 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1181  pentapeptide repeat protein  26.14 
 
 		 230 aa  51.2  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.329473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2466  pentapeptide repeat-containing protein  28.12 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  27.82 
 
 		 442 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1144  pentapeptide repeat-containing protein  28.24 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  26.47 
 
 		 862 aa  51.2  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  30.11 
 
 		 389 aa  50.8  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  29.17 
 
 		 447 aa  50.8  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  25.9 
 
 		 401 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  34.81 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2446  acetyltransferase  18.31 
 
 		 308 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.034806  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  25.15 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  29.76 
 
 		 880 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  31.97 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  33.77 
 
 		 420 aa  50.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  28.48 
 
 		 180 aa  50.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  32.08 
 
 		 881 aa  50.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  21.67 
 
 		 211 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  20.6 
 
 		 187 aa  49.3  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  28.27 
 
 		 223 aa  49.7  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  30.99 
 
 		 234 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  30.99 
 
 		 234 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  27.21 
 
 		 384 aa  49.3  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  28.47 
 
 		 446 aa  49.3  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  30.95 
 
 		 872 aa  49.3  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  28.66 
 
 		 206 aa  48.9  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5828  pentapeptide repeat protein  28.79 
 
 		 189 aa  49.3  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510799  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  26.13 
 
 		 381 aa  48.9  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  33.67 
 
 		 319 aa  48.9  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  20 
 
 		 214 aa  48.9  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  23.33 
 
 		 211 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2153  pentapeptide repeat-containing protein  31.76 
 
 		 245 aa  48.9  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.281285  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  24.29 
 
 		 193 aa  48.5  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0991  hypothetical protein  29.21 
 
 		 95 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  21.67 
 
 		 211 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  24.44 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  18.58 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2126  pentapeptide repeat-containing protein  19.89 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  29.94 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  28.85 
 
 		 174 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  27.38 
 
 		 710 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  23.93 
 
 		 734 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2429  acetyltransferase, gnat family  20.16 
 
 		 155 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.287092 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  22.42 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0530  pentapeptide repeat-containing protein  20.19 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  24.32 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3782  pentapeptide repeat-containing protein  22.22 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0386  pentapeptide repeat protein  44.44 
 
 		 509 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>