199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2466 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2466  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
220 aa  435  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1144  pentapeptide repeat-containing protein  83.64 
 
 
220 aa  323  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1028  pentapeptide repeat-containing protein  89.2 
 
 
180 aa  307  6.999999999999999e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.22421  normal  0.0351171 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  22.44 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5595  pentapeptide repeat protein  29.41 
 
 
221 aa  68.2  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  26.49 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  26.49 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  26.49 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  25.83 
 
 
211 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  25.95 
 
 
227 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  24.5 
 
 
211 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  26.25 
 
 
229 aa  62  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  25.17 
 
 
211 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  30.56 
 
 
232 aa  61.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3302  pentapeptide repeat protein  24.08 
 
 
225 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  26.25 
 
 
229 aa  58.5  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  28.81 
 
 
872 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  23.44 
 
 
567 aa  55.1  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18320  uncharacterized low-complexity protein  32.69 
 
 
233 aa  54.7  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109994  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  30.82 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  20.69 
 
 
190 aa  54.7  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  22.58 
 
 
187 aa  53.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2126  pentapeptide repeat-containing protein  20.83 
 
 
200 aa  53.9  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  31.71 
 
 
206 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  22.28 
 
 
356 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  29.47 
 
 
862 aa  53.9  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  26.5 
 
 
485 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2845  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)-like protein  81.25 
 
 
84 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74729  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  27.78 
 
 
452 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  29.17 
 
 
309 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6181  pentapeptide repeat-containing protein  27.1 
 
 
201 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.309204  normal  0.0469485 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  26.43 
 
 
215 aa  52.8  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  21.35 
 
 
381 aa  52.4  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  24.39 
 
 
218 aa  52.4  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35000  uncharacterized low-complexity protein  26.79 
 
 
216 aa  52.4  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  28.35 
 
 
416 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  26 
 
 
453 aa  52  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  25.36 
 
 
268 aa  52  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  25.57 
 
 
250 aa  52  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5828  pentapeptide repeat protein  25.55 
 
 
189 aa  52  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510799  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  26.46 
 
 
576 aa  52  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  22.12 
 
 
216 aa  52  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0869  pentapeptide repeat protein  22.98 
 
 
290 aa  51.2  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.236368  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  26.6 
 
 
340 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  20.43 
 
 
607 aa  51.2  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  25.14 
 
 
205 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  25.82 
 
 
880 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  26.32 
 
 
332 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000904  hypothetical protein  23.5 
 
 
216 aa  51.2  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3044  pentapeptide repeat protein  27.27 
 
 
253 aa  50.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157086  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  24.55 
 
 
218 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  24.1 
 
 
844 aa  51.6  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0870  pentapeptide repeat-containing protein  23.35 
 
 
635 aa  50.8  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  25.7 
 
 
880 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  25.7 
 
 
880 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  25.7 
 
 
880 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  25.7 
 
 
880 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  28.74 
 
 
218 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  26.2 
 
 
261 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  23.16 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  25.41 
 
 
727 aa  49.3  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  25.9 
 
 
223 aa  49.7  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  25.26 
 
 
234 aa  49.3  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  25.27 
 
 
877 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  27.5 
 
 
1191 aa  48.9  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  24.38 
 
 
517 aa  48.9  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.69 
 
 
14916 aa  48.9  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2086  helix-turn-helix domain protein  23.39 
 
 
327 aa  48.9  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0272363  normal  0.126806 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2377  acetyltransferase, GNAT family  18.84 
 
 
308 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.198921  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  25.44 
 
 
389 aa  48.5  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  30.22 
 
 
872 aa  48.5  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2059  pentapeptide repeat-containing protein  27.27 
 
 
214 aa  48.5  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361738  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  23.71 
 
 
401 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  25.14 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  24.48 
 
 
197 aa  48.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  23.3 
 
 
320 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  25.26 
 
 
776 aa  47.8  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  27.73 
 
 
370 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0440  pentapeptide repeat-containing protein  19.89 
 
 
601 aa  47.4  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  20 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  24.22 
 
 
225 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2954  acetyltransferase, GNAT family  18.84 
 
 
312 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878787  hitchhiker  0.00000560426 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  26.95 
 
 
449 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1872  pentapeptide repeat protein  21.51 
 
 
194 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  24.16 
 
 
278 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  26 
 
 
452 aa  47  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1751  pentapeptide repeat-containing protein  24 
 
 
212 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00861009  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  23.35 
 
 
264 aa  47.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  22.49 
 
 
201 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  25.42 
 
 
600 aa  46.6  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  23.71 
 
 
401 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  24.06 
 
 
193 aa  46.6  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0318  pentapeptide repeat-containing protein  25.81 
 
 
452 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  23.03 
 
 
312 aa  46.2  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  26.95 
 
 
219 aa  46.2  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1489  pentapeptide repeat protein  27.35 
 
 
187 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0526071  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  22.95 
 
 
745 aa  46.2  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  24.07 
 
 
204 aa  45.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  20.38 
 
 
245 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3692  pentapeptide repeat-containing protein  25.43 
 
 
218 aa  46.2  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.413415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>