183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_35000 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_35000  uncharacterized low-complexity protein  100 
 
 		 216 aa  427  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2940  pentapeptide repeat protein  40.91 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2386  hypothetical protein  41.4 
 
 		 199 aa  135  5e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.193618 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26860  uncharacterized low-complexity protein  36.41 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3044  pentapeptide repeat protein  39.77 
 
 		 253 aa  125  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3064  pentapeptide repeat protein  39.16 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3269  pentapeptide repeat-containing protein  37.42 
 
 		 228 aa  108  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5595  pentapeptide repeat protein  34.71 
 
 		 221 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2786  hypothetical protein  33.13 
 
 		 217 aa  96.7  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3302  pentapeptide repeat protein  29.26 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  25.62 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  27.8 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  26.06 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  28.32 
 
 		 576 aa  59.3  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  22.41 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  27.89 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  28.76 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  24.44 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  22.41 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  23.76 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1144  pentapeptide repeat-containing protein  27.98 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  20.69 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  21.26 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  24.72 
 
 		 381 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  21.26 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5828  pentapeptide repeat protein  28.69 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510799  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2126  pentapeptide repeat-containing protein  26.09 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  23.41 
 
 		 229 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  25.64 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0440  pentapeptide repeat-containing protein  23.16 
 
 		 601 aa  52.8  0.000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0867  pentapeptide repeat-containing protein  24.41 
 
 		 185 aa  52.8  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  26.8 
 
 		 309 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  28.66 
 
 		 205 aa  52.4  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  22.93 
 
 		 233 aa  52.4  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2466  pentapeptide repeat-containing protein  26.79 
 
 		 220 aa  52  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  21.82 
 
 		 190 aa  52  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1181  pentapeptide repeat protein  25.14 
 
 		 230 aa  51.6  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.329473 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3619  pentapeptide repeat protein  26.72 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0594601  decreased coverage  0.000131742 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  25.32 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 319 aa  51.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  26.67 
 
 		 452 aa  50.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  23.49 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  24.86 
 
 		 449 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  26.86 
 
 		 600 aa  49.7  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  25.94 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  23.94 
 
 		 448 aa  49.7  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  26.26 
 
 		 320 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  25 
 
 		 294 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  24.39 
 
 		 877 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  23.89 
 
 		 363 aa  50.1  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  26.7 
 
 		 521 aa  49.3  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  26.4 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  25.95 
 
 		 517 aa  49.3  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1432  pentapeptide repeat protein  29.52 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  26.82 
 
 		 197 aa  49.7  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1028  pentapeptide repeat-containing protein  25.6 
 
 		 180 aa  49.3  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.22421  normal  0.0351171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  22.82 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  25.53 
 
 		 370 aa  48.9  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  23.81 
 
 		 870 aa  49.3  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  24.89 
 
 		 232 aa  48.9  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  29.53 
 
 		 1033 aa  48.5  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  25.38 
 
 		 199 aa  48.5  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  26.79 
 
 		 343 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  26.79 
 
 		 343 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6181  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 201 aa  48.5  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.309204  normal  0.0469485 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3729  hypothetical protein  22.22 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.626497  normal  0.855124 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  23.78 
 
 		 880 aa  48.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  28.65 
 
 		 193 aa  48.1  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  31.25 
 
 		 198 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  24.54 
 
 		 489 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2588  pentapeptide repeat-containing protein  26.14 
 
 		 162 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0911  pentapeptide repeat protein  25.87 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545668 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2591  pentapeptide repeat-containing protein  24.29 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  26.12 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  23.78 
 
 		 880 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  23.78 
 
 		 880 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  23.78 
 
 		 880 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  23.78 
 
 		 880 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  26.82 
 
 		 706 aa  47.8  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  26.24 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  23.16 
 
 		 268 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  26.05 
 
 		 739 aa  47.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0861  pentapeptide repeat-containing protein  27.72 
 
 		 354 aa  47.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0186818  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  26.05 
 
 		 739 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  26.05 
 
 		 739 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  21.48 
 
 		 191 aa  46.6  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  26.85 
 
 		 862 aa  46.6  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2086  helix-turn-helix domain protein  24.22 
 
 		 327 aa  46.6  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0272363  normal  0.126806 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  24.05 
 
 		 446 aa  46.6  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  24.36 
 
 		 949 aa  46.6  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  24.07 
 
 		 440 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  27.17 
 
 		 261 aa  46.6  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  24.07 
 
 		 727 aa  46.2  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  25.84 
 
 		 245 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  27.52 
 
 		 259 aa  46.2  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  28.68 
 
 		 452 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  27.04 
 
 		 191 aa  46.2  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  27.62 
 
 		 254 aa  45.8  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4064  mcbg protein, putative  22.86 
 
 		 265 aa  45.8  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  27.74 
 
 		 355 aa  45.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>