155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3064 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3064  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
224 aa  447  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3269  pentapeptide repeat-containing protein  73.54 
 
 
228 aa  306  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26860  uncharacterized low-complexity protein  42.66 
 
 
220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2786  hypothetical protein  36.49 
 
 
217 aa  138  7.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35000  uncharacterized low-complexity protein  41.53 
 
 
216 aa  135  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3044  pentapeptide repeat protein  39.2 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157086  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5595  pentapeptide repeat protein  37.44 
 
 
221 aa  114  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2940  pentapeptide repeat protein  37.43 
 
 
201 aa  111  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2386  hypothetical protein  32.22 
 
 
199 aa  89.7  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.193618 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  28.16 
 
 
191 aa  63.2  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  25.33 
 
 
227 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  27.07 
 
 
206 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  25.14 
 
 
229 aa  58.9  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  30 
 
 
600 aa  56.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  25.6 
 
 
448 aa  56.6  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3302  pentapeptide repeat protein  25 
 
 
225 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  27.27 
 
 
401 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 
299 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5828  pentapeptide repeat protein  28.1 
 
 
189 aa  55.1  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510799  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  29.78 
 
 
219 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  27.96 
 
 
197 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  26.67 
 
 
401 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  27.75 
 
 
261 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  27.21 
 
 
320 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  28.04 
 
 
493 aa  53.1  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  25.13 
 
 
198 aa  52.8  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0440  pentapeptide repeat-containing protein  25.13 
 
 
601 aa  52.4  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  23.35 
 
 
227 aa  52.4  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  22.37 
 
 
211 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  25.85 
 
 
179 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  29.09 
 
 
174 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  27.85 
 
 
263 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  24.87 
 
 
229 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  25.3 
 
 
370 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  29.95 
 
 
872 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  25.36 
 
 
381 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  27.74 
 
 
242 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  24.63 
 
 
567 aa  50.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  30.11 
 
 
412 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  21.92 
 
 
211 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  25.62 
 
 
351 aa  49.7  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  24.31 
 
 
193 aa  49.7  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  26.62 
 
 
291 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  26.62 
 
 
291 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0861  pentapeptide repeat-containing protein  28.66 
 
 
354 aa  48.9  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0186818  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  30.06 
 
 
336 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  25.87 
 
 
197 aa  48.9  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  30.06 
 
 
336 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  24.86 
 
 
300 aa  48.5  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  28.18 
 
 
1191 aa  48.5  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  23.65 
 
 
776 aa  48.5  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  27.7 
 
 
254 aa  48.5  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  26.39 
 
 
440 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  26.09 
 
 
218 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  25.85 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 
446 aa  47.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13397  hypothetical protein  29.58 
 
 
183 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.102743 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  26.79 
 
 
449 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  30.63 
 
 
332 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  25.73 
 
 
205 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1432  pentapeptide repeat protein  28.83 
 
 
228 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  26.86 
 
 
213 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  26.29 
 
 
576 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  26.79 
 
 
333 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1082  pentapeptide protein  23.78 
 
 
614 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  27.01 
 
 
213 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4336  pentapeptide repeat-containing protein  24.87 
 
 
187 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789922  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  26.95 
 
 
389 aa  47.4  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1144  pentapeptide repeat-containing protein  25.59 
 
 
220 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2466  pentapeptide repeat-containing protein  24.87 
 
 
220 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  26.2 
 
 
456 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  25.14 
 
 
200 aa  47  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  28.74 
 
 
340 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  25.45 
 
 
521 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  25.52 
 
 
319 aa  46.6  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3668  pentapeptide repeat-containing protein  26.87 
 
 
699 aa  46.6  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  30.28 
 
 
204 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  24.17 
 
 
739 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  24.17 
 
 
739 aa  46.6  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  24.17 
 
 
739 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  30.82 
 
 
309 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  25.18 
 
 
309 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0089  pentapeptide repeat-containing protein  29.91 
 
 
156 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0543  hypothetical protein  29.25 
 
 
354 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0318  pentapeptide repeat-containing protein  24.29 
 
 
452 aa  45.8  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0613  hypothetical protein  29.25 
 
 
354 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205681  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07131  pentapeptide repeat-containing protein  29.91 
 
 
156 aa  45.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.180589 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0724  hypothetical protein  29.25 
 
 
354 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1682  hypothetical protein  29.25 
 
 
354 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  24.86 
 
 
182 aa  45.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2059  pentapeptide repeat-containing protein  26.11 
 
 
214 aa  45.8  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361738  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  24.6 
 
 
234 aa  45.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18320  uncharacterized low-complexity protein  26.91 
 
 
233 aa  45.4  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109994  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  26.98 
 
 
452 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1328  pentapeptide repeat protein  26.19 
 
 
929 aa  45.4  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000290536  hitchhiker  0.0000145927 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  26.26 
 
 
862 aa  45.1  0.0009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2034  pentapeptide repeat-containing protein  29.25 
 
 
354 aa  45.1  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895251  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  25.43 
 
 
727 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2777  pentapeptide repeat-containing protein  18.26 
 
 
124 aa  44.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.13799  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  23.94 
 
 
311 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>