103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3269 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3269  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 228 aa  455  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3064  pentapeptide repeat protein  73.54 
 
 		 224 aa  304  7e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26860  uncharacterized low-complexity protein  41.55 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2786  hypothetical protein  34.12 
 
 		 217 aa  131  7.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35000  uncharacterized low-complexity protein  39.66 
 
 		 216 aa  128  7.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3044  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5595  pentapeptide repeat protein  35.45 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2940  pentapeptide repeat protein  33.17 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2386  hypothetical protein  33.33 
 
 		 199 aa  90.9  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.193618 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  29.69 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  23.66 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  25.99 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  27.64 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3302  pentapeptide repeat protein  24.32 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  19.81 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  26.46 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  26.32 
 
 		 261 aa  53.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  23.12 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  26.35 
 
 		 448 aa  52.4  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  25.89 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  28.22 
 
 		 449 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_002978  WD0440  pentapeptide repeat-containing protein  24.58 
 
 		 601 aa  50.4  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  26.2 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  25.63 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  26.39 
 
 		 412 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  23.75 
 
 		 521 aa  48.9  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  27.66 
 
 		 600 aa  48.9  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6181  pentapeptide repeat-containing protein  27.42 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.309204  normal  0.0469485 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  21.94 
 
 		 233 aa  48.9  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  24.24 
 
 		 190 aa  48.5  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  23.98 
 
 		 218 aa  48.5  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  24.34 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  30.19 
 
 		 309 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  23.49 
 
 		 370 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  25.6 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  25.31 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  25 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  24.18 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  24.73 
 
 		 200 aa  47.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  25.16 
 
 		 333 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  24.69 
 
 		 870 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  22.7 
 
 		 355 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  21.51 
 
 		 866 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  25.81 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13397  hypothetical protein  28.1 
 
 		 183 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.102743 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  24.24 
 
 		 401 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0911  pentapeptide repeat protein  23.79 
 
 		 215 aa  46.6  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  26.82 
 
 		 320 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  28.81 
 
 		 872 aa  46.6  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  24.62 
 
 		 389 aa  45.8  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0318  pentapeptide repeat-containing protein  24.05 
 
 		 452 aa  45.8  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  21.09 
 
 		 776 aa  45.8  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  24.38 
 
 		 186 aa  45.4  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  26.11 
 
 		 186 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  27.75 
 
 		 452 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  20.71 
 
 		 381 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  26.28 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  22 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  23.33 
 
 		 452 aa  44.3  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1144  pentapeptide repeat-containing protein  25.14 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  26.79 
 
 		 299 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  25 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  27.59 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  24.83 
 
 		 294 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  23.64 
 
 		 401 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5828  pentapeptide repeat protein  25.49 
 
 		 189 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510799  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  25.51 
 
 		 576 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4336  pentapeptide repeat-containing protein  23.08 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2059  pentapeptide repeat-containing protein  21.91 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  23.61 
 
 		 440 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  24.56 
 
 		 311 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18320  uncharacterized low-complexity protein  27.61 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  27.52 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2312  pentapeptide protein  27.4 
 
 		 149 aa  43.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0828621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  23.13 
 
 		 351 aa  43.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  27.18 
 
 		 263 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  22.58 
 
 		 739 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  25.38 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  22.58 
 
 		 739 aa  43.5  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  22.58 
 
 		 739 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  27.01 
 
 		 199 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2126  pentapeptide repeat-containing protein  21.53 
 
 		 200 aa  42.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  24.84 
 
 		 358 aa  42.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0183  pentapeptide repeat-containing protein  30.39 
 
 		 170 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08151  hypothetical protein  30.39 
 
 		 170 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  25.64 
 
 		 1191 aa  42.4  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  24.1 
 
 		 242 aa  42.7  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  26.85 
 
 		 193 aa  42.7  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  25.73 
 
 		 243 aa  42.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2262  pentapeptide repeat protein  20.94 
 
 		 215 aa  42.7  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  22.4 
 
 		 880 aa  42.4  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  21.67 
 
 		 567 aa  42.4  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38880  hypothetical protein  26.71 
 
 		 215 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  25.14 
 
 		 862 aa  42.4  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  22.4 
 
 		 880 aa  42.4  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  22.4 
 
 		 880 aa  42.4  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  22.4 
 
 		 880 aa  42.4  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2777  pentapeptide repeat-containing protein  24.59 
 
 		 124 aa  42.4  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.13799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  21.58 
 
 		 880 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  23.29 
 
 		 213 aa  42  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>