129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2386 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2386  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  394  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.193618 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35000  uncharacterized low-complexity protein  41.4 
 
 		 216 aa  135  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2940  pentapeptide repeat protein  34.5 
 
 		 201 aa  105  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26860  uncharacterized low-complexity protein  31.12 
 
 		 220 aa  91.3  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3044  pentapeptide repeat protein  30.36 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3269  pentapeptide repeat-containing protein  33.12 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3064  pentapeptide repeat protein  32.12 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2786  hypothetical protein  26.7 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5595  pentapeptide repeat protein  26.53 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  31.01 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  29.28 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  26.34 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  28.97 
 
 		 206 aa  62  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  20.73 
 
 		 211 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  28.02 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  22.22 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  21.72 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  25.61 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  21.72 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  26.28 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  21.72 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  26.23 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3302  pentapeptide repeat protein  27.89 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  24.26 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  20.21 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  23.08 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  18.86 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  27.16 
 
 		 261 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  25.67 
 
 		 229 aa  52.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  24 
 
 		 600 aa  52.8  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3729  hypothetical protein  20.1 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.626497  normal  0.855124 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  26.46 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  20.88 
 
 		 370 aa  52.4  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1181  pentapeptide repeat protein  26.16 
 
 		 230 aa  52.4  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.329473 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  23.13 
 
 		 320 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  18.58 
 
 		 227 aa  52  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  22.93 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  24.5 
 
 		 567 aa  50.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1872  pentapeptide repeat protein  19.1 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  24.36 
 
 		 309 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  21.94 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  23.35 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  21.21 
 
 		 355 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5828  pentapeptide repeat protein  26.02 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510799  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  20.28 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  24.83 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  23.68 
 
 		 311 aa  48.9  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  22.62 
 
 		 576 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3427  pentapeptide repeat-containing protein  20.81 
 
 		 367 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3556  pentapeptide repeat-containing protein  20.81 
 
 		 367 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  29.91 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  20 
 
 		 381 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  26.12 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  21.74 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  24.86 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  24.06 
 
 		 710 aa  45.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0530  pentapeptide repeat-containing protein  20.17 
 
 		 225 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  22.56 
 
 		 356 aa  45.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  21.98 
 
 		 229 aa  45.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0554  pentapeptide repeat-containing protein  20.17 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2126  pentapeptide repeat-containing protein  20.43 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  24.62 
 
 		 408 aa  45.8  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2262  pentapeptide repeat protein  24.21 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0992  hypothetical protein  24.73 
 
 		 119 aa  45.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2312  pentapeptide protein  27.83 
 
 		 149 aa  45.8  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0828621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3782  pentapeptide repeat-containing protein  20.17 
 
 		 220 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0610  pentapeptide repeat-containing protein  18.18 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  25.93 
 
 		 201 aa  45.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  23.6 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  19.63 
 
 		 286 aa  45.1  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4621  pentapeptide repeat-containing protein  20.61 
 
 		 430 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3961  pentapeptide repeat-containing protein  20.61 
 
 		 333 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0697467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  24.55 
 
 		 291 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4336  pentapeptide repeat-containing protein  21.02 
 
 		 187 aa  45.1  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  24.18 
 
 		 256 aa  44.7  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  24.55 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  21.17 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  26.52 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0725  pentapeptide repeat-containing protein  23.89 
 
 		 568 aa  44.3  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.967446  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  23.84 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3445  pentapeptide repeat-containing protein  19.53 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  27.88 
 
 		 900 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  23.84 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  23.84 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  22.14 
 
 		 401 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  21.09 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0558  pentapeptide repeat protein  21.74 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  22.14 
 
 		 401 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  24.54 
 
 		 351 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  22.6 
 
 		 448 aa  43.5  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  21.26 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1751  pentapeptide repeat-containing protein  24.84 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00861009  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  21.08 
 
 		 776 aa  43.5  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  26.36 
 
 		 332 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  26.12 
 
 		 242 aa  42.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  22.73 
 
 		 384 aa  42.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  22.12 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2059  pentapeptide repeat-containing protein  20 
 
 		 214 aa  42.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  22.49 
 
 		 242 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5571  hypothetical protein  20.61 
 
 		 430 aa  43.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.422571  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>