90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2786 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2786  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  423  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26860  uncharacterized low-complexity protein  42.58 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3064  pentapeptide repeat protein  35.38 
 
 		 224 aa  125  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3269  pentapeptide repeat-containing protein  34.12 
 
 		 228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35000  uncharacterized low-complexity protein  33.13 
 
 		 216 aa  96.7  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3044  pentapeptide repeat protein  38.18 
 
 		 253 aa  93.2  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5595  pentapeptide repeat protein  32.42 
 
 		 221 aa  92.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2940  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 201 aa  89  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2386  hypothetical protein  26.7 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.193618 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3302  pentapeptide repeat protein  31.54 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  23.15 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  20.94 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5828  pentapeptide repeat protein  29.41 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510799  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  20.94 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  20.94 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  21.27 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6181  pentapeptide repeat-containing protein  31.44 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.309204  normal  0.0469485 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  24.07 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  22.88 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  20.94 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  20.94 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  27.52 
 
 		 311 aa  53.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  28.14 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  20.94 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  20.45 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  25.14 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  19.35 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  28.48 
 
 		 600 aa  51.2  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  30.36 
 
 		 900 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  24.5 
 
 		 448 aa  50.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  26.28 
 
 		 567 aa  49.7  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2262  pentapeptide repeat protein  20.19 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0318  pentapeptide repeat-containing protein  25.17 
 
 		 452 aa  48.5  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  23.66 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  27.49 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  27.87 
 
 		 515 aa  45.8  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  24.32 
 
 		 234 aa  45.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2559  pentapeptide repeat-containing protein  26.32 
 
 		 163 aa  45.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  26.45 
 
 		 184 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  28.97 
 
 		 877 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 233 aa  45.1  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  23.97 
 
 		 179 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  20.83 
 
 		 401 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  27.72 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  27.47 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  27.88 
 
 		 355 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  20.83 
 
 		 401 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  28.97 
 
 		 880 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  28.97 
 
 		 880 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  27.56 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  26.67 
 
 		 866 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  26.32 
 
 		 449 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  25.9 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  25.26 
 
 		 295 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  31.18 
 
 		 576 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1181  pentapeptide repeat protein  26.32 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.329473 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  22.45 
 
 		 381 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  22.06 
 
 		 440 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  32.69 
 
 		 412 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4336  pentapeptide repeat-containing protein  24.27 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  22.76 
 
 		 386 aa  43.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  26.17 
 
 		 263 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  29.63 
 
 		 452 aa  43.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  22.58 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  23.56 
 
 		 727 aa  43.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  31.68 
 
 		 332 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  22.94 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  22.3 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  24.32 
 
 		 447 aa  42.7  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3668  pentapeptide repeat-containing protein  26.43 
 
 		 699 aa  42.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  28.28 
 
 		 880 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  28.28 
 
 		 880 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  28.28 
 
 		 880 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1892  hypothetical protein  23.46 
 
 		 716 aa  42.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  29.71 
 
 		 1831 aa  42.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2466  pentapeptide repeat-containing protein  20.6 
 
 		 220 aa  42.4  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  28.36 
 
 		 291 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  22.22 
 
 		 300 aa  42.4  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  28.3 
 
 		 309 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  26.32 
 
 		 745 aa  42  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  32.26 
 
 		 412 aa  42.4  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  25.25 
 
 		 408 aa  42.4  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  27.87 
 
 		 291 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  27.4 
 
 		 881 aa  42  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  30.36 
 
 		 870 aa  42  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  24.32 
 
 		 521 aa  41.6  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  25 
 
 		 286 aa  41.6  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  29.27 
 
 		 1033 aa  42  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  26.42 
 
 		 363 aa  41.6  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  23.74 
 
 		 320 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>