260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0182 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
190 aa  375  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  48.68 
 
 
197 aa  192  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  41.8 
 
 
190 aa  159  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  40.96 
 
 
193 aa  157  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  40.76 
 
 
193 aa  154  8e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  37.77 
 
 
193 aa  147  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1489  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 
187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0526071  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  37.3 
 
 
214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  39.68 
 
 
187 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1295  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  38.38 
 
 
194 aa  138  4.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75651  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  41.82 
 
 
180 aa  137  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  36.17 
 
 
193 aa  135  4e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  31.05 
 
 
191 aa  120  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1483  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  32.04 
 
 
206 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3404  pentapeptide repeat-containing protein  35.64 
 
 
192 aa  117  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00102719  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  36.32 
 
 
186 aa  117  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2490  pentapeptide repeat-containing protein  34.04 
 
 
196 aa  105  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0867  pentapeptide repeat-containing protein  32.97 
 
 
185 aa  105  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  29.17 
 
 
199 aa  102  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0610  pentapeptide repeat-containing protein  33.14 
 
 
205 aa  94  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2591  pentapeptide repeat-containing protein  30.32 
 
 
204 aa  94  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0530  pentapeptide repeat-containing protein  31.72 
 
 
225 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3782  pentapeptide repeat-containing protein  31.38 
 
 
220 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0558  pentapeptide repeat protein  31.89 
 
 
220 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0554  pentapeptide repeat-containing protein  31.38 
 
 
220 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3620  pentapeptide repeat-containing protein  30.73 
 
 
208 aa  92  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4064  mcbg protein, putative  30.81 
 
 
265 aa  89.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3445  pentapeptide repeat-containing protein  29.69 
 
 
208 aa  88.6  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0506  pentapeptide repeat-containing protein  29.69 
 
 
208 aa  88.6  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  29.33 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0277  pentapeptide repeat-containing protein  27.96 
 
 
195 aa  82  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  29.17 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1872  pentapeptide repeat protein  27.69 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  30.86 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  30.29 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  30.29 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  30.82 
 
 
211 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  27.81 
 
 
183 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  24.83 
 
 
227 aa  71.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  29.52 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  30.82 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  30.19 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1438  pentapeptide repeat protein  34.07 
 
 
202 aa  68.9  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0273991  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  29.86 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  26.58 
 
 
229 aa  67.8  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  25.54 
 
 
198 aa  67.4  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  26.43 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  26.04 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  28.77 
 
 
739 aa  64.7  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  28.77 
 
 
739 aa  64.7  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  28.77 
 
 
739 aa  64.7  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2102  hypothetical protein  24.88 
 
 
217 aa  63.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  28.25 
 
 
452 aa  63.5  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 
197 aa  62.8  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  25 
 
 
200 aa  62.4  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  23.81 
 
 
183 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  23.81 
 
 
183 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  23.81 
 
 
183 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  24.88 
 
 
218 aa  61.2  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  26.4 
 
 
261 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  26.4 
 
 
218 aa  60.1  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  25.15 
 
 
197 aa  59.7  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  25.7 
 
 
216 aa  59.7  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  24.17 
 
 
218 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2059  pentapeptide repeat-containing protein  25.25 
 
 
214 aa  59.3  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361738  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  25.65 
 
 
844 aa  58.9  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  24.26 
 
 
205 aa  58.9  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3960  pentapeptide repeat-containing protein  25.74 
 
 
229 aa  58.5  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  22.35 
 
 
204 aa  58.2  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  24 
 
 
242 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3302  pentapeptide repeat protein  25.5 
 
 
225 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  22.7 
 
 
206 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  29.53 
 
 
348 aa  57.4  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0493  hypothetical protein  29.88 
 
 
1048 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000904  hypothetical protein  28.57 
 
 
216 aa  57  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  26.57 
 
 
232 aa  56.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  27.78 
 
 
976 aa  56.6  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  26.71 
 
 
359 aa  57  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  28.57 
 
 
349 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0517  hypothetical protein  29.88 
 
 
1048 aa  56.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  22.38 
 
 
224 aa  56.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  22.55 
 
 
223 aa  55.8  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  24.09 
 
 
250 aa  56.2  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3692  pentapeptide repeat-containing protein  23.66 
 
 
218 aa  55.5  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.413415  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  26 
 
 
355 aa  55.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  21.54 
 
 
193 aa  55.5  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  22.88 
 
 
360 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  22.88 
 
 
360 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  23.68 
 
 
242 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  22.88 
 
 
360 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1144  pentapeptide repeat-containing protein  24.49 
 
 
220 aa  55.1  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  20.43 
 
 
191 aa  55.1  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  23.72 
 
 
949 aa  55.1  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  22.88 
 
 
360 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  22.88 
 
 
360 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  26.82 
 
 
201 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  22.99 
 
 
862 aa  55.1  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2466  pentapeptide repeat-containing protein  20.81 
 
 
220 aa  54.7  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  25.9 
 
 
370 aa  53.9  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  22.22 
 
 
360 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>